卫所制度有着严重的弊端，违反了军事专业化的大趋势，卫所制虽然能够最大程度调动人员和物资，洪武皇帝的理想是养兵百万，不消耗百姓一粒粮食，这只能成为美好的愿望，士兵短缺粮食，在明朝的军队中屡屡出现。并且卫所制度产生了明朝特有的军籍，军户世代为兵成为了一种沉重的负担。另外，卫所制度借鉴了府兵制度，直接造成将不识兵，兵不识将，这样在战时的配合与协调就成了最致命的问题，而且在天启年间，陕西、辽东的私人军队甚者成为超越卫所的士兵，成为大明王朝对外作战的主力部队。
卫所制度造成了更为严重的问题是，士兵的后顾之忧，无法得到有效保障，就连最基本的医疗都无法保证，这样的士兵如何有战力，如何能够在这乱世所向披靡。所以，崇祯想到了变革医疗，来一步步提升大明军队的战斗力。
“张爱卿，你思考这么久，有好的建议没有。”崇祯没有把想法直接说出，想试试看这个张炳良是不是有真才实学，还是凭借关系爬上来。
“启禀皇上，臣思考了许久，有几点想法，不知当讲不当讲。”张炳良并非庸碌之辈，能走到今天这一步，靠的自己医术和过硬的政治水平，否则，这太医院院使也轮不到自己来做。
“但说无妨，朕恕你无罪。”崇祯不是不懂变通之人，既然张炳良这样说，定然有些想法会触及到一些人的利益或者不在自己的职权范围内，这些都是官场大忌，所以张炳良有些犹豫也很正常。
“臣有两点想法，其一，大量培养医术人才，现在大明的医疗归属于礼部，臣肯请陛下诏令礼部开设医疗科举，来选拔顶级的医疗人才，这些选拔上来的人才在分配给地方和军队中效力。”张炳良说了第一点，似乎也感觉自己的想法有些大胆了，禁不止抬起头看了看崇祯皇帝，发现崇祯没有恼怒的现象，反而听得很认真了，忐忑不安的心才放下。停顿了一会儿张炳良继续说道：“其二，就是药材供应的问题，治疗外伤的药物很是短缺，士兵们得不到有效治疗，很大程度是这些药物无法到达士兵手中。按大明军制，士兵受伤后，军队里面的医生，只能够草草处理，一方面人手不够，另一方面就是没有足够的药物。而且，这些士兵大多是军户，战争一结束，受伤的士兵更是无人照料，所有的药物必须要自己花钱购买，在这样的情况下，连吃饱都成问题，哪会有多余的钱买药。”
张炳良说完不自觉叹了一口气，这是为这些受伤死去的士兵而叹气，作为太医院的院使，虽然远离战争，但是地方医疗也是自己的管辖范围，所以对这些是非常清楚的，再加上这是兵部的事情，自己一个小小的太医院院使，还没有能力去改变这种现状，这种无能为力的感觉，真的很难受。