如此一来，目标范围就缩小多了。西班牙、荷兰等西方国家的战舰，当然也有这个能力，但他们的战舰外观与福船区别很大，另外也不可能有中国人和日本人。那就只剩下一种可能：海盗！
而当前盘踞在东亚海洋上的海盗势力，最大的无疑是郑芝龙。郑芝龙虽然在名义上接受了朝廷的招安，还官拜福州总兵官、水师都督，但从不在福建登岸，只是借着这身官衣，更加明目张胆地进行走私贸易，碰到别的船只就抢，俨然是海上的土皇帝。
既然大海是郑芝龙的安身立命之所，他自然也对海战非常重视。朱由检在登州亲眼见过郑芝龙的旗舰“宝船”，竟然是八千料的庞然大物，就连西方国家的海军亦不可望其项背。除旗舰外，大小战舰亦多如牛毛，且均装备了横帆与火炮，在东亚海域算是非常先进了。因此别看郑芝龙的老巢魍港在台湾，而荷兰与西班牙均侵入了台湾，但他们也不敢与郑芝龙轻启战端，三方在海上维持着脆弱的平衡。
至于其他海盗，能有这种战舰规模的还有两家：李旦、林凤。李旦也是福建人，和郑芝龙是同乡，“出道”比郑芝龙还早，据说郑芝龙刚做海盗时，还认过李旦为干爹。李旦与日本倭寇勾结颇深，据说与德川幕府还有千丝万缕的联系。但郑芝龙崛起后，李旦的势力受到打压，加上本人年纪也大了，不得不暂避锋芒，主要在琉球一带活动。
而林凤则更为“传奇”，据说竟是一名年轻女子。她“子承父业”，接手了父亲的海盗势力以后，主要在吕宋岛附近活动，而且与西班牙人和郑芝龙都发生过冲突。
朱由检最怀疑的当然是郑芝龙。其他海盗，一是离长江口太远，二是没有动机。而郑芝龙对朝廷一直阳奉阴违，朱由检早就怀疑他有异心。
再说当年朱由检以秦王的身份迎娶戚美凤，天下轰动，郑芝龙自然也不可能不知道。他弟弟郑芝豹与戚美凤的婚事被“戚俭”搅黄了，郑芝龙就是再笨，现在也应该猜到“戚俭”就是当今天子朱由检了，岂能不惊惧？以此推断，郑芝龙很有可能会与白莲教勾结，救出朱由崧等人，彻底与朝廷决裂。
但毕竟郑芝龙现在还没有公开叛乱，朱由检就算怀疑他，也需要有充足的证据。明着调查肯定不行，那样即使郑芝龙没反也得被迫反了。所以他才要锦衣卫暗中调查，查实以后，再决定如何应对。
当一口气看完严振纲送来的密奏后，朱由检拍了拍滚烫的额头，苦笑着道：“怕什么来什么，郑芝龙这个王八蛋还真反了…”