隆庆海运所延续的时间并不长，涉及的范围也不甚广，但仍具积极意义。第一，明朝海运主要是为了供给北京以及辽东军饷，海运相对运河漕运，效率高、费用少，能及时有效地实现供给。这次海运，暂时缓解了其时黄河屡次决口河漕难行从而摆在明政府眼前的最急迫的问题，达到了其最初目的；第二，实行海运进一步沟通了南北方联系，为南北海上贸易奠定了基础，促进了山东、京津等地方区域经济的发展；第三，当时山东等地海防久弛，实行海运的同时连带加强了海防。
在试行海运的同时，还著做了《海运新考》，此书“论海道曲折颇为详备”，将实行隆庆海运前前后后的奏疏、疏议、奏记、考说辑在一起，其内容包括了：“海道总图”“咨访海道”“试行海运”“海道蠡测”“海道捷径”“海道口岸”“海道里数”“海道日程”“海道湾泊”“海道通禁”“申严海防”等等。
处于明朝北方边境东部的蒙古土蛮部，不断入犯辽东边塞，张居正掌权后，梁梦龙作为他的门生受到重用，并担任户部右侍郎，后改任兵部右侍郎，曾去辽东奖励有功将士。遇母丧丁忧，除服后，梁梦龙以兵部左侍郎、兼都察院右都御史总督蓟辽、保定军务，梁梦龙认为：“国家备御九边，按图画地，方册具备。边臣无他奇谋，只在办实心，干实事耳。”在这种思想的指导下，他刚到任即体察军情，问四镇军疾苦，并为其剔除。
梁梦龙在任期间，简军实，修马政，筑城堡，谨烽堠，慎择将领，以忠、勇、勤为上，无取恹然者，并说：“犹之相马，不举肥也。”他对待戚继光、李成梁这样的有功宿将，皆推诚任之，使得“目无文法吏”的有功宿将“独就梦龙约束”。在梁梦龙的“目营手画，口次指授”下，“行之期年，边备修举”，由此军势大振，以至“虏小入则小创，大入则大创”“酋长久识其姓名，部落已惮其威令矣”。
在辽东，最显眼的是取得了一次次的大捷：土蛮等三万骑入犯东昌堡，梁梦龙称：“团营结阵，难与争锋，急以精锐出边，擣营救险，一鼓可擒也。”李成梁率游击秦得倚等提兵出二百里塞外，果大胜，斩部长九人，余级八百八十四。土蛮等四万骑从前屯、锦川营等堡深入攻掠，梁梦龙亲率劲卒三千出山海关为李成梁声援，又分遣两参将遮击，并移戚继光驻一片石邀之，三军奋勇，大破来犯者，梁梦龙任职蓟、辽总督期间，先后奏大捷者九，受诏褒奖十余次。
在蓟门最卓著、并流传至今的贡献是筑台修城，明人经略蓟、昌者多主张守，“而守之所最先者，一为修台，一为修墙”。之前谭纶、刘应节、杨兆、王一鹗以及戚继光等人均对台墙加以修筑并不断改进。梁梦龙认为：“蓟镇十二路，古北口为要，各路次之。昌平三路，黄花镇为要，各路次之。”所以他立志修筑完成这两处边墙。这一工程规模较大，施工难度也较大：“二千里间处处设险，工力之钜，殆汉、唐以来未有者”。
大功告成，共修成蓟镇边墙5363丈，敌台101座，铲削偏坡587丈，并建潮河川大桥一座；昌平修边墙4641丈，敌台10座，铲削偏坡55处。为维护明王朝边疆的稳定做出了贡献，其所修筑的边墙、敌台有的至今仍存。
由于在蓟辽之任贡献突出，得到很高荣誉，在镇逾年，就任加兵部尚书，边墙功竣，加太子少保，三年考满，再荫子至锦衣卫百户世袭，赐白金文绮，间以飞鱼坐蟒。锡予便蕃，使命络绎，近代边臣未有也”。赵南星向明廷颂扬梁梦龙功绩：“今天下多事，求一筹边任事之臣不易得。则皇祖初年，中土久安，四裔宾服，其时仗钺诸臣竭忠宣力之效不可没也”。