光绪二年，宋骁飞赶回京城后，慈禧太后和恭亲王奕欣的权力斗争再次白热化，李鸿章再次面临站队问题。
这一次，宋骁飞的想法，是将恭亲王和清流都连根拔起，全部扳倒。
当然，这需要争取慈禧太后的支持，幸运的是，这时候，慈禧太后扳倒恭亲王和清流的愿望，明显比宋骁飞要强烈得多。
慈禧和恭亲王这对反目的“情侣”，也没有什么深仇大恨，说到底，还是权力的斗争。
光绪皇帝即位后，清廷的政治权力格局发生了变化：两宫太后依旧垂帘听政，慈安太后还是名义上的一号人物，慈禧只能算“女二号”，恭亲王继续主管总理衙门和军机处，权力依然很大，尤其是军机处，基本没变化，还是恭亲王的地盘。慈禧公开说，军机处是“针插不进，水泼不进”的“阎王殿”，而“鬼子六”恭亲王就是“阎王爷”。
而军机处在清朝地位特殊，从雍正年间开始，军机处虽然都是兼职，但总揽军政大权，凌驾于六部之上，地位相当于现在的国务.院加中.央军.委，所以军机大臣地位相当于现在的中.央政.治.局常.委，加上两宫太后，就是大清的最高决策机关。
慈禧一直都想染指军机处，但没什么效果。李鸿章虽然深得慈禧的信任，官居一品，但在军机处也是靠边站的人物。光绪元年的军机处由五人组成，即恭亲王奕欣武英殿大学士文祥协办大学士宝鋆协办大学士沈桂芬工部尚书李鸿藻，其中只有李鸿藻一人还是慈禧太后以“帝师”的名义安插进去的，其他四人都是恭亲王的“死党”。
慈禧太后拉拢慈安太后，在光绪皇帝即位的问题上独断专行，绕过了军机处，对固守正统的清流大臣也是极大的刺激，他们认为慈禧违背了清朝祖制。光绪登基，恭亲王虽措手不及，但很快稳住了脚跟，联合“清流”大臣开始反击。
就在光绪登基不久，内阁侍读学士广安就受恭亲王的指使，上奏了一折子，请求把光绪皇帝即位的事立个“铁券”，永不变更，言下之意，是防止慈禧再生花样，废了光绪皇帝再立新君。更让慈禧不可接受的是，广安要求召开王公六部九卿扩大会议，进行讨论，慈禧大怒，将广安流放，发配边疆。
不过，“清流”有一点让恭亲王和世人都很看重，就是“不怕死”，敢于“死谏”。
慈禧好不容易把广安制造的舆论压制下去，吏部主事吴可跳出来，他更为激进，当时阿鲁特皇后没有死，还怀着身孕，他要求光绪皇帝死后，必须立同治皇帝的子嗣为皇位继承人，为了制造轰动效应，他义无反顾地选择到同治帝陵墓附近服毒自尽。
几千年来，大臣死节是中国人最欣赏的，不管他的要求合不合理，慈禧太后马上变得很被动。
吴可死后，朝野震惊，恭亲王不但没有压制舆论，还在军机处里讨论此事，这次连李鸿藻都觉得自己身为臣子，应该站在恭亲王的那一边。慈禧很孤立，地位也岌岌可危，她强烈地意识到，如果掌控不了军机处，她就难以成为大清名副其实的“一号人物”。
慈禧下决心对付恭亲王奕欣和清流大臣，还有另一个重要原因，她目光长远，看到了“十年”之后。她眼看光绪皇帝一天天长大，如果不把强势的奕欣和不要命的清流大臣扳倒，一旦等到光绪皇帝到了亲政的年纪，慈安绝对会表态退出垂帘听政，她到时候孤掌难鸣，绝不可能再像对待同治皇帝那样，对光绪皇帝的亲政一拖再拖。
而打击恭亲王的机会，很快来了。
光绪二年，武英殿大学士军机大臣文祥病故。文祥是1861年北京政变的老臣，他和宝鋆多年来一直是恭亲王的左膀右臂，他一死，军机大臣的位置就空出来一个，慈禧太后最先想到了帅叔李鸿章。
晚上，李鸿章和幕僚在庭院商议此事时，盛宣怀李凤苞张树声都建议他入军机，毕竟汉臣当军机大臣是难得的荣耀和机遇。
宋骁飞抬头望着一轮昏月，没有说话。李鸿章问他的意见，宋骁飞说：“上次恩师批评我没有搞清朝廷的情况，我特意补了一下功课。现在朝廷的局势，就像这夜幕一样漆黑一团，军机大臣这位置，像头顶的一轮昏月，看上去有一种朦胧美。实际上，到时候恩师会很尴尬。”
李鸿章点点头:“这也正是老夫忧虑的地方。”