时庞统及诸位文臣武将早起必来问安，金旋每日疲于应付，召庞统相议改革政治。将庞统之丞相府更名为国事馆，庞统为总理，以蒋婉、法正、鲁肃为副总理。蒋婉分管各郡政务，辖各郡太守；法正分管各部政务，辖六部官吏；鲁肃分管诸军防务及各路接应使军务。法正所辖，为兵部、礼部、邢部、吏部、工部、户部，使鲁肃兼兵部部长，管辖各地守备及马超、甘宁、严颜、诸葛谨四路接应使，直接向庞统负责。简雍为礼部部长，管学事、礼仪、祭天、国家婚丧喜事等事务。以张宏为邢部部长，掌全国刑事、治安、诉论等事务。以伊籍为吏部部长，掌全国官吏之出入、考核、升降等事务。以王累为户部部长，掌全国钱粮、税收、农务、粮库等事务。以马良为工部部长，掌科技、工具、兵器、运输等诸务。未尽诸事，各官发现不妥，即上报庞统，由庞统分派。
金旋随命庞统于长安建立学院，任命蒋济为院长，招募贤能文士，培训后任学院文教师，教授诸子学问。命马超挑军中能者为武教师，授诸子武艺。诸臣之子也可入学就读。聘当时大贤司马徽、管辂出山，供职学院。天下诸郡，皆设学舍，为学院基层，招各地优秀子弟入学，优秀者可考录入学院。金旋闲暇时又整理孔子之书，去其糟粕，名曰《孔学》；将原所撰四书加以天文、地理等内容，合其书为一，名曰《圣书》。又使各郡每年小考，优者重奖，各郡好学之风渐长。后孔明又撰书《诸葛亮杂学》，记诸葛亮平生作战之过程、心得及易学等，金旋命设兵务一课，将此书与孙吴兵法同时教授。中国之后百年，科技日新月异，与金旋之重教育、撰理论、建学院有绝大关系。
学务处理完毕，金旋又命庞统改革税务，将税种由人头税改为财产税，即由原来由每人分摊改为按拥有土地数量、商铺规模来分摊，使富豪合理交税，取消各地摊派。又使户部设福利院，收养无人赡养之老人、孤儿等。命户部丈出全国土地，将各郡闲置土地，收归国家，召流民分地耕种，按其地等次收其租金。命各郡农闲之时，集壮丁修水利，筑道路。
又命扩建医馆，使华佗为医馆馆长，负责全国医务，纳各郡游医于内，择其专长命华佗分类教授。学成后分派各郡，以国家薪金奉养。又命华佗择才能之士研究化学药物，即当今西药。华佗穷一生精力，培训佳徒无数，天下人多受其恩泽，又研究出数种消炎药物，各种不治之症多有治愈者。后百姓奉之为“医神”，学医之人奉其为祖师。
为防止官员腐败，金旋命各郡设举报箱，举报箱由金旋派人每三个月收缴一次，举报箱钥匙皆置于金旋书房。金旋亲开举报箱，凡被举报的腐败官吏，查实后均处以严刑。择有才贤能之士出任各地官员，升官吏薪金，曰“********”，官场之风大整。金旋又命各郡每年选年老德众者五人，赴京论诸事利弊，纠执政之失。
时百姓多有信道教者，江东于吉、洛阳左慈于百姓中皆有威信。金旋诏于吉为护军真人，命于会稽山建道观，使于吉居此。诏左慈为护民真人，命于嵩山建观，使左慈居此。会稽、嵩山自此为天下道教圣地。
金旋、庞统于长安改革政务之时，诸葛亮在洛阳统率原姜维所辖大军，约定时日，命诸路大军同时进击，周瑜部攻乐陵，关羽部攻陈留，陆逊部攻濮阳，姜维部攻邺城，自引洛阳军攻许昌。时洛阳军共二十一万，诸葛亮留李严率军五万守城，自率军十六万攻打许昌。
许昌曹植接连接报，金旋诸军同时出动，攻打陈留、乐陵、濮阳、许昌四地，大惊失色，急召众人商议。贾诩曰：“今金旋兵众，诸将多谋，不易胜之。可急命各郡巩固城防，聚集粮草，以备久守，折敌军锐气。然后伺机出战，或可退其兵。”曹植纳其言，下诏使各郡行之。