“默认了山姆雷米的建议。“我相信托比一马本尔不会让您失望的！”山姆一雷米信誓旦旦的在电话里向林木立下了“军令状”。
在山姆雷米的大力推荐下，制片方很快就和托比一马本尔答约，为了塑造身手了得的蜘妹侠，托比一马本尔在影片开拍前接受了长达数周的体能练，练项目包括跑步、蹦床、瑜伽、举重和骑自行车等。让姆雷米甚至想要让托比一马本尔学习一些华夏功夫的动作，但是林木的建议下他放弃了这个打算。而林木劝说他的理由很简单，蜘蛛侠是西方意识形态中的超级英雄，出现东方的功夫动作会显得不伦不类。
除了对主演进行必要的体能练之外，剧组的另外一项重要的工作就是设计蝙蝠侠的服装。制片方请来了曾经获得过3次奥斯卡奖的服装设计师詹姆斯一艾奇逊，但是山姆雷米不想重新设计蜘妹侠的服饰，而是希望在原有基础上加以改动。为了满足山姆一雷米的要求，詹姆斯采用了很多重要的技术，他利用丝网印花工艺将肌肉组织印在服装表面，这样既可以保证蜘妹侠的灵动，又可以不必穿着笨重的肌肉服装就体现出结识的结实的肌肉线条。
为了满足拍摄的需要，剧组一种制作了十套这样的服装，其中大部分服装不得不用于呈现出受损的外观。当然不仅是蜘蛛侠的服装如此的兴师动众，影片中的方面角色绿魔的服装也同样纷繁复杂，全身由旺个造型部件组成，扮演绿魔的威廉每次都要花费半个小时才能在铭剧组人员达协助下穿着妥当。
在一切准备就绪之后，影片于3月份在派拉蒙的第六号摄影棚搭建了块妹侠彼得一帕克的住所，除去为数众多的棚拍之外，影片剧组还选取了洛朽矾的多处实景，用于拍摄哥伦比亚大学研究实验室内景的自然历史博物馆、用于拍摄《号角日报》办公室内景的太平洋电力大厦和由于拍摄绿魔住所内景的比佛利山的灰石豪宅。
影片在使用临时演员方面也破了一个小小的记录，为了拍摄在影片中出现的时代广场集市镜头，剧组招募的演员多达几千人，此外剧组还征集了四名6-8到岁的儿童参加影片的拍摄，这些小朋友在影片中的任务是受到惊吓而尖叫和哭泣。林木事先并不知道这个消息，但是一份好莱坞的早报登载了这个消息，这个报道为了吸引读者太特意用了一个醒目的标题：“山姆一雷米，这个鬼片导演究竟想要干什么？”
撰写这篇报道的记者只是采访了几个参与演出的小演员和他们明显带有偏见的父母，就草率的得出了自己的结论，他认为山姆一雷米会在《蝙蝠侠》中添加恐怖片的成分来取悦观众。
这篇报道对于作为制片方的派拉蒙并没有造成太大的影响，虽然不少董事都对这篇报道将信将疑。但在林木没有明确的表态之前，他们也只是在心底揣测一番。尽管制片方保持缄默，但是这篇报道的负面效应还是波及到影片的拍摄。影片剧组收到了有关部门的调查通知。他们要求剧组对其在影片中涉嫌惊吓未成年人的行为作出合理的解释。
同时很多蜘蛛侠的粉丝也对山姆一雷米的做法表示了不满，他们认为在这样一部经典的影片中加入恐怖片的元卑是对原著的一种背叛，他们在洛朽矾还掀起了一场小规模的游行示威，甚至还有蜘妹侠的粉丝们聚集在剧组拍摄地的外围，高举着诸如“让山姆一雷米滚蛋”这样的标语，向剧组表示抗议。
事态发展了到了这样的地步。大大的出乎了林木的预料，这让他又一次领教了媒体捕风捉影的超强本领。导演山姆一雷米因为这件事情受到了很多人的质疑，在这个时候他是百口莫辩，只有林木站出来替他解围。
尽管不愿意泄露太多影片的拍摄内幕，但是林木还是极力澄清了有关恐怖片的谣传，他表示影片中会加入一些惊险刺激的镜头，但绝对不是像一些媒体所胡乱猜测的那种恐怖片，这是他和导演山姆一雷米在托摄之初就已经设定好的元素。“如果影片中出现的镜头能称得上是恐怖片，那么我相信所有游乐园中的过山车都应该被取饰，按照这样的逻辑。乘坐过山车也属于儿童不宜的范畴”。
达次小小的“虐童”事件最后在剧组提供了有关这出拍摄记录以及超过蹦名在片中表演的儿童的证词，这才平息了这场风波。一件毫不起眼的小事，却可以在美国闹得如此沸沸扬扬，林木在感慨美国社会制度严谨的同时，并没有要继续深究此事的打算。
但是导演山姆一雷米可不这么想。他认为正是由于那家报社的不实报道。才引发了这一系列不必要的麻烦，所以他决定起诉那家报社，要求其赔偿这段时间因为此事影响剧组的拍摄进度所带来的经济损失和名誉补偿。加州法院开庭的审理了这宗案件，一开始林木只是抱着试试看的心态，但是拔出萝卜带出泥，随着案情调查的不断深入，操纵这家报社的幕后黑手渐渐的浮出水面。
这家报社最后承认这篇报道得到了来自好莱坞某家大公司的暗示，这个消息让林木警惕了起来，他觉的这件事情似乎并不是像他一开始想象的那么简单，根据那家报社在法庭上的证词，他断定这件事一定是有人在背后捣鬼，暗中唆使这家报社进行有针对性的报道。
案情进展到这个阶段，派拉蒙的高层终于觉得认真的对待这件事情。林木觉得不揪出幕后的黑手这事决不能罢休。派拉蒙高价聘请专门的公司对此事展开调查，并以包庇罪再次起诉那家报社，在强大的压力和证据面前，这家报社终于承认那篇不实报道得到了索尼公司（原哥伦比亚影业公司，后被索尼收购）的指派。
这个消息一公布就在美国引起轩然大波，不正当竞争的手段来挤压对手在美国商业社会中是最严重的信誉损失，尽管索尼立即对此事作出回应，单方面否认的参与过这件事情。但是一位公司高管与报社主管的电话录音证明了一切。索尼公司的股价还是连续三个交易日暴跌。在证据确凿、舆论形势一边倒的情况下，派拉蒙并没有放弃这个痛打落水狗的机会，公司以不正当竞争罪向联邦法院起诉索尼公司，如果这项罪名成立，索尼将要面临了巨额的罚款。
案情的审理将会是一个漫长的司法过程，但是索尼公司在这次事件中扮演了不光彩的角色，在这次事件中可谓是遭受重创，无论最后的判决结果如何，派拉蒙这次成功的反击压制住了索尼，也让其他的公司收敛了他们的小动行。从受害者成为最后的赢家，派拉蒙打了一场漂亮的翻身战，所以这非常值得庆贺，当然这也是林木所乐于见到的事情。