不过，刘云无法容忍东瀛帝国逍遥法外，他趁丰臣秀吉挂掉，东瀛内部大名开始内战的时机，迅速出兵，控制了德川、石田、毛利、岛津、伊达等主要大名，让东瀛帝国对外仍称独立，但实际上国内已经是刘云的天下，刘云可以随意掠夺东瀛的各种资源。
不久，李如柏也病死了，关外的李家舰队犹如军阀，形成了一个利益集团。崇祯为了控制关宁舰队，便派了袁崇焕去当关宁舰队的最高军政长官。
此时，后金舰队开始压迫关宁防线，东北压力增大。
与此同时，李自成、张献忠出兵攻击各地官军，被称为“流贼”，西南播州也发生叛乱，中央帝国内乱四起。
这是中央帝国的绝大危机，是崇祯的危机，不过对于刘云来说，这是他的一个大好机会。
此时的刘云已经打造了一支拥有五万六级战列舰的强大舰队，这时他领了崇祯的命令，独立领军前往西南播州平叛。
播州的土司舰队战斗力是低下的，用不着刘云兴师动众去打，不过，刘云出动大部队的目的是占领沿途的安南星域，从下南方包抄播州，扩张势力范围。于是，这场战争又打了三十年，平定播州之时，刘云已经稳稳地在安南星域扎下根来了。
如今，刘云控制的星系已经达到五百多万个，实力相当雄厚，六级战列舰的数量超过十万，全部都拥有中子装甲
不过，时间拖得越久，中央帝国的形势越加恶劣，上东北方，袁崇焕只能死守他的星系，出战则无法战胜后金舰队。西部，李自成和张献忠的舰队越来越庞大，他们拥有一项技术，可以回收战舰残骸的天河玄石，生产新的战舰，所以舰队数量越来越惊人，据说已经超过百万，虽然只是乌合之众，但也不可小视。
中央帝国已经左支右绌，如果调集关外舰队，可以打败流贼，但帝都就会危险，如果调集关内舰队，可以击退后金，但流贼将会坐大，真是难以两全。这时候，崇祯再次想起那个同宗同源的“藩属”，已经封为“抚远大将军”的刘云。
因此，刘云又欣然领了剿灭流贼的任务。
李自成和张献忠的流贼舰队在强大的华夏舰队面前确实是乌合之众，他们没有任何优势。李自成他们可以回收天河玄石，但拥有中子装甲的六级战舰很少会被摧毁，流贼没法回收残骸，而且面对刘云，流贼只有失败的份，哪有时间捡残骸？因此，李自成的舰队在刘云的围追堵截中越来越少，不过，这个时间拖得很久了，因为流贼最擅长打游击战，广渺的星空距离动辄百万光年，搜寻流贼舰队相当困难。
时间越久，变数越多，终于，在李自成、张献忠即将失败之时，时空战场发生了重大变故。
主神们派来的新管理员——罗睺，已经来到时空战场，接替无能的耶和华。这一次，罗睺的实力空前强大，目前刘云没法打败他，但罗睺也别想打败刘云，但是罗睺拥有时空战场的最高管理权，他给了后金帝国一项终极武器——母皇巨星。
母皇巨星确实是一个庞然大物，比地球还要大，是一个直径15000公里的巨大球体，里面可以装载六级战列舰以十万计，加上超级次元舱的储存，可以装载超过百万大军
母皇巨星最厉害的还不是这个，而是它的超级攻城主炮——空间海啸巨炮，所释放的空间海啸，能够撕裂数千立方光年的空间，杀伤范围内的恒星发生强烈爆炸，行星等物体化为齑粉，特别是对空间城池的破坏力非常强大虽然发射一次空间海啸需要巨额能量，相当于5000个太阳燃烧100亿年的能量，也就是说一场战斗下最多发射一次，但一次就足以解决问题。
后金皇太极利用母皇巨星，一举将宁远星系的空间城墙炸开一个大洞，摧毁附近无数防守战舰，然后大军一拥而上，占领了宁远星系，袁崇焕身死。
而后，大凌河星系陷落，祖大寿投降。
锦州星系群全线落入后金帝国之手。
中央帝国最强的要塞星系——山海关星系，在后金母皇巨星的暴力轰击之下，轰然陷落，十三万战舰全军覆没，帝都危急
此时，刘云火急火燎地率领舰队赶往帝都星系，但是赶到之时已经晚了。
后金大军蜂拥而进，在帝都星系里烧杀抢掠，大肆破坏，崇祯皇帝朱由检在皇宫后山准备上吊，陪同他的只有他最忠诚的智能机器人——王承恩。
好在刘云及时阻止了崇祯。
“陛下臣救驾来迟，不过臣的舰队已经控制了皇宫周围的星区，后金舰队攻不进来，但我们必须尽快撤离，后金的超级武器很快就可以充能重新发射了”刘云急忙劝道。
此时的朱由检一脸颓丧，披头散发，摇头道：“不，太祖的基业败在我的手中，我必须负这个责任。我已经没脸在九泉之下见列祖列宗了，所以披发覆面，只求一死”
刘云见朱由检死志已决，叹了口气，摇头准备离开，忽然朱由检道：“刘爱卿，现在只有你能挽救中央帝国了这是传国玉玺，现在我交给你，禅位于你，希望你能力挽狂澜，不要让帝国亿万百姓惨遭建奴屠戮”说罢，朱由检按动按钮，瞬间化为一阵青烟，湮灭了。
……
以上是官方记载，记叙了刘云如何得到中央帝国皇位的经过。
而实际发生了什么事呢……
其实，当时刘云是故意来晚的，他要得到一个名正言顺的皇位，以最小的代价统领这个庞大的中央帝国，所以朱由检必须死。当然，刘云并没有杀朱由检，他赶到皇宫的时候，朱由检已经自杀了，刘云找到传国玉玺，然后编造了这样一段“禅位”的经过。
之后，刘云的舰队和后金舰队遭遇了，经过一番激战，刘云杀敌甚众，后金即将败退。但就在这时，后金的母皇巨星再次开火了，刘云感受了一次空间海啸的威力，就这么一下，他的舰队受损过半如果不是拥有中子装甲，刘云就全军覆没了
此时的刘云非常愤怒，率领伤痕累累的舰队发动猛烈攻击，集中攻击后金的母皇巨星虽然母皇巨星的防御非常强大，舰队一时难以攻破，但刘云亲自动手了现在的刘云修为大增，一道道隐秘的空间震荡拍入母皇巨星之中，将里面的后金官兵屠戮殆尽，然后，这颗巨大的母皇巨星就沦为刘云的战利品了。
这时候，剩余后金战舰仓皇逃窜。
于是，刘云收复了帝都星系，并且称帝了，直接改中央帝国为华夏帝国。
这时候中央帝国各地都不怎么服这个新皇帝，但刘云不在意，只要他完全击败后金，驱除鞑虏，这个皇位就名正言顺了，太祖朱元璋就是这样得到皇位的，得位之正古今少有。