这样使得原以二氧化碳、一氧化碳为主的还原性大气，转化成为以氧气、氮气为主的氧化性大气。生物的生命活动对地球物质的循环有着十分巨大的作用。由于生物的呼吸作用和植物的光合作用，大气中的二氧化碳大约每300年可循环一次；氧大约每2000年循环一次。
生物对铁、钙、氮、磷等的循环也有很大的影响。地球森林植被中约含有碳素4000～5000亿吨。石炭纪是蕨类植物繁茂的时代，大量的植物残体在沼泽环境中转化为煤层。这样大量的碳素被掩埋地下，导致大气中二氧化碳含量的减少，并由此削弱了温室效应，引起了全球性的气候变化。也许，古生代晚期的冰川就可能与此有关。
植物登陆之后，和地表的岩石层相互作用，开始形成土壤。土壤是陆地表面的疏松多孔体，又是一个胶体系统，对于植物生活所需要的水分和养分有强大的吸附和释放作用。土壤的形成使得易于流失的水和养分，能在地表富集起来。土壤既是植物生活的物质基础，又是植物生活的产物。
土壤肥力的提高促进了植物的生长与发展，植物的繁茂又进一步促进了土壤肥力的提高。植物界的繁盛又为动物和微生物的生存发展，提供了物质基础和生存空间。
地壳在地球的发展史上经历了许多巨大的变动。最先的时期是地壳发生剧烈变动的时期，重生代早期是海洋占优势的时代，海洋无脊椎动物空前繁盛。到了发展后期，陆地面积大大增加，新的亚欧大陆和新的北美大陆的雏形已基本形成，此时两栖类开始出现，动物开始由水生向陆地发展。这时期的北半球气候炎热，陆地上出现了大面积的植物分布。由蕨类植物组成的大面积的森林覆盖地表，是一个重要的造煤时期。
同时裸子植物在蕨类的基础上发生。地球新生时代的中、晚期，全世界大部分地区都属热带、亚热带气候，季节变化不明显，是爬行动物的全盛期。爬行动物在形态结构和生殖方式(体内受精、生产大型的羊膜卵