安政六年中，就在以长州藩、四国藩为首的五万藩兵围攻京都城的第三天，皇城二条城内传出二条天皇的圣旨：一条圣旨是封嫡亲次子睦仁为伏见宫博恭亲王，是为皇太子；另一条圣旨则是饬令城外的长州藩兵为叛军，大逆不道攻打“天领”，责令速速退走，可既往不咎，又号令各方军队不可滥杀无辜，伤及百姓。
伴随着回应圣旨的，是隆隆的火炮声和杀喊声。
京都城内外，数万大军已经早就做好了厮杀的准备，正激烈地战斗着。
京都这座千年古都，完全是模仿中国隋唐时代的长安和洛阳两城，整个建筑宫殿呈长方形排列，以贯通南北的朱雀路为轴，分为东西二京，东京仿照洛阳，只不过比例缩小了十倍不止，而西京模仿长安，正中间的，便是为皇城——二条城。皇城之内是皇宫，也就是所谓的二条御所，皇城之外为都城。
整个都城内街道呈棋盘形，东西、南北纵横有秩，布局整齐划一，明确划分皇宫、官府、居民区和商业区。这本来是一片繁华之地，但此时，却是一片狼藉，浓烟四起，百姓哭喊一片的景象。
都城外，长州藩和四国藩的联军架设着仅有的百余架火炮，对着京都城内便是一阵猛轰。而京都城墙上的三十多门火炮，根本不是城外火炮的对手，几轮功夫，便哑火了半数之多。
这还不是最主要的，重点是京都城内，个居民区和商业区纷纷呢冒起了大火，浓烟滚滚。
会津藩的藩主松平容保领着会津藩兵和城防兵英勇地在城墙上同城外的联军作战，京都所司代酒井忠义领着百余城防办精锐和新选组等数百名流浪武士在城内四处搜捕纵火的藩兵内应。
但城内的倒幕派武士也不下百人，四处放火更是难以防范，不到半日功夫，整个京都已经是一片火海。原本京都城内的百姓在以前的保元平治、应仁的战火后，就非常惧怕火灾。如今的大火比当初的火灾看起来还要猛烈，哪还有人有心思救火，于是乎，城内的平民和商贩纷纷出逃。这样一来，原本守城的会津藩兵和京都城防兵便兵力不足，再加上被城内的乱民和夹杂其中的藩士奸细作乱冲击，京都城的外城门一个不慎，便被城外的藩兵攻破了。
松平容保和酒井忠义连忙率领着数千手下放弃外都城，退守皇城。但此时，已经于事无补了。
京都城外，潮水般的长州藩兵和四国藩兵纷纷冲入被打开的城门，进入京都城内。
长州藩的国司信浓、益田右卫门介二名家老护卫着藩主毛利敬亲，亲自领兵开始攻击京都皇宫的蛤御门，镇守蛤御门的正是会津藩的藩主松平容保，双方展开激战。国司信浓更是下令长州藩兵架设火炮，轰击皇宫。
会津藩兵虽然英勇，但毕竟寡不敌众，渐渐不敌，坚持半天之后，会津藩兵战死近千人，京都城防兵死伤数百，眼见守不住了，松平容保率领一帮会津兵躲入皇宫之中，其余的守军尽皆逃散。
皇城也被攻破了。
御所的最深处，是一处御花园。
孝明天皇和皇妃中山庆子肩并肩站在一处山涧，看向山涧下的一处浅浅的水潭，漫山的绿叶红花，一片盛夏的美景，但透过这些枫树，身后皇宫处阵阵杀喊声传来。
没过多久，一阵嘈杂的脚步声进入御花园，几声惨叫响起之后，一名手持武士刀、身穿蓝色羽织的年轻武士，面无表情，却当先一脚踢开花园大门，领着数十名流浪武士冲了进来。