参、众两院对段的答复都不满意，众议院作出决定：关于派遣特使案，应于事前征求国会同意，否则不能予以承认。
黎元洪和国会只是就法理程序反对曹赴日，却不知道曹去日本是为了进行秘密外交，所以他们都不反对派特使到日本，而只反对派曹为特使。
由于这个原因，段乃改变方法，把派遣特使赴日授勋事弄假成真地作为一个外交礼节。
十二月十三日北京政.府下令：“派熊希龄前往日本呈递大勋位。”
这道命令中并未给熊以特使名义，以避免又要征求国会方面的同意。可是这道命令发表后，又引起了日本的反对。
本来在派熊命令发布前，已获得日本“没有反对熊”之意，不料命令发表后，日本外相本野忽又面告章宗祥说：“贵国政.府拟派曹汝霖，我们已奏明天皇，我国舆论也一致表示欢迎。今又改派熊希龄，足见贵国政.府的内部并不一致，今后人选可能随时会变，与我国舆论也不一致，请熊先生展期来日。”
这是日本自拒绝周自齐后又一次拒绝接待中国特使。日方非正式透露他们反对熊的理由，是说熊曾在民国二年七月通电揭露日本分割中国的阴谋，因此不适当充任这个使节。
这件事拖到民国六年二月二十七日，日本政.府同意中国改派汪大燮赴日赠勋，才告一段落。
黎元洪与段祺瑞之间的政争，一九一七年对德外交问题上达到白热化的程度。
一九一七年春，第一次世界大战正在欧洲激烈进行。其间，日本借西方列强大战之际，加紧侵略中国，在西方列强中，只有尚未参战的美国，有余力对日本在侵华问题上论短长。
二月初美国宣布对德绝交后，试图拉中国与美国同步。美驻华公使芮恩施连日拜谒黎元洪、段祺瑞，要求中国与美国采取一致行动。
黎对美国素具好感，希望在外交上得到美国的支持，以与以日本为靠山的段祺瑞抗衡，所以欣然接受芮恩施的要求。
段祺瑞也赞成与德国绝交，一则因为美使芮恩施极力宣扬如中国与美国采取一致行动，战后会获得巨大利益，使段颇为动心。再则段祺瑞通过驻日公使章宗祥探询日本政.府态度，日本并无反对中国与德国绝交之意。
故此，二月九日，北京政.府就德国潜艇封锁公海一事向德国提出抗议。
日本原来反对中国参战，但当获悉美国插手中国对德外交、企图左右中国政局的动向之后，立即转而积极支持中国参战，以同美国争夺对中国参战的控制权。
段祺瑞也试图借参战之机，依靠日本，借款练军，扩充皖系实力，特向日本保证今后对德问题均“与日本取同一之态度”。
美国见掌握北京政.府实权的段内阁完全按日本意旨行事，显与美国当初拉中国参战的意图相违背，于是又转而反对中国参战。并通知中国政.府，在对德问题上不必与美国取一致态度。
美国态度的转变又影响了黎元洪集团，黎一变而为对德绝交和宣战的反对者，段祺瑞则成为这一政策的积极推进者。黎、段在对德问题上的冲突，正是美、日两国不同政策的反映。
三月三日，段祺瑞主持的国务会议通过对德绝交案，并拟就致驻日公使章宗祥的电稿，令章通告日本政.府，中国即与德国绝交。
四日，段率阁员至总统府，要黎在对德绝交咨文上盖印。黎认为事关重大，以还需慎重为辞，拒绝盖印。
段愤怒离去，当晚即宣布辞职，离京赴津。
黎本想乘段离京之机改组内阁，以徐世昌或王士珍出面组阁，但徐、王均坚拒不就。
此时恰值副总统冯国璋来京磋商外交问题，黎即请冯出面调停。冯答应调停，但需黎接受不反对内阁确定的外交方针，对国务院拟发之命令不拒盖印，对内阁致各省及驻各国使节之训电不提异议等三项条件。
黎元洪没办法，只能表示接受。
六日，冯亲赴天津迎段返京。
七日，段即到国务院办公。八日，段将经黎盖印之对德绝交咨文提交国会。十日、十一日两天，参、众两院分别通过对政.府外交政策信任案。
十四日，北京政.府正式宣布对德绝交。