“莱维特先生你好，我是这次科幻新星赛金奖得主，也是你的粉丝。”</p>
鹅厂帮他安排的是在莱维特入住酒店的会议室见面，除了他们两还有郭伟陪同，莱维特笑着和陈元光握手道：“你好，我也很喜欢你的作品，它很有意思。</p>
里面很多对未来的推演都很有意思。”</p>
陈元光说：“这大概是因为我对科学比较关注，对前沿技术很关注，所以能做出一些有意思的成绩来吧。</p>
先生，这次我见你，主要是有一篇论文想请你指正，我构建了一种计算机模拟的方法，来对蛋白质的定向进化进行模拟。</p>
这种方法仅需要利用蛋白质物理化学的特征和序列信息，就能够实现蛋白质定向进化的模拟。</p>
我选择的研究对象是蛋白质DHR8，通过计算机模拟，让它进化出有结合DNA或者RNA的能力。</p>
在模拟进化之前，我先对序列多样性与结合核酸的情况，去构建了一个包含30个五肽重复蛋白的评估库。</p>
五肽重复蛋白是经过证实的RNA结合蛋白，它的结合位点很清晰，已经被系统表征。</p>
这样一来我评估库中的每一個PPR都会具备两个明确的结合位点，我们以每个结合位点为中心，将长度为13个氨基酸的短序列作为一个评估窗口，这样的话它一共会有60个评估窗口。</p>
对于每一个评估窗口的短序列，我们利用现成数据库中的544个描述氨基酸的物理化学性质的指标来表示氨基酸，因此，每一个位点的氨基酸就会是一个544×1的矩阵，十三个这样的矩阵合并用以表示一个长度为13的肽段序列。</p><div id='gc1' class='gcontent1'><script type='text/javascript'>try{ggauto();} catch(ex){}</script>