尤其让朱由检感到焦虑的是,李定国与一些秦兵感染上了疟疾！做为一个穿越之人,朱由检当然知道疟疾的厉害.这是一种通过蚊虫叮咬传播的恶性传染病,本身这种忽冷忽热的症状已经让人非常痛苦,反复发作后还会导致贫血,最终致人死亡.在没有抗生素的这个时代,如果爱将李定国被这种可恶的传染病击倒,甚至失去生命,无疑是朱由检的重大损失,所以必须让他马上返回京师,先把病治好了再说.
第三,则是朱由检对贵州,四川等地土司的深层思索.毫无疑问,叛军都是彝族等少数民族,他们参与了叛乱,但罪魁祸首是安邦彦和奢崇明,其余大多是被蒙蔽和裹挟.现在这两个人已经死了,如果把永宁和水西叛军斩草除根,固然也是一法;但彝人也是大明子民,官军又不是女真人,蒙古人那样的野兽军队,不可能实行全族屠杀政策.
如此一来,就会在彝人心中埋下深深的仇恨.虽然这次叛乱被镇压下去,可是几年,十几年以后,当这些被杀叛军的后代渐渐长大,他们会不会在仇恨的驱使下再次叛乱
所以朱由检决定攻心为上.他公开降诏,并立即给重庆,成都,毕节等地飞鸽传书,做出以下决定:一,将消极避战的四川巡抚刘汉儒革职,成都知府朱燮元暂时署理四川,陈天工则暂时署理重庆府.二人要尽快恢复当地秩序,让逃难的百姓返回家乡,必要时可与接管蜀王府的锦衣卫商议,暂借蜀王府中粮饷赈济灾民.陈天工还要扼守住奉节,严防流贼从峡江道突入四川.
二,前任贵州巡抚王三善遇害后,贵州巡抚一直空缺.朱由检在毕节设毕节府,一方面是为"改土归流"做铺垫,另一方面也破格提拔傅宗龙为正四品毕节知府,给了他一个合适的身份.然后让傅宗龙暂时署理贵州.
而军事方面,令秦良玉率白杆兵驻于毕节.对于水西残敌,暂时不予追剿,而是给他们三个月的时间投降.只要能主动投降,除了犯有滥杀,奸银妇女等重罪者外,一律既往不咎,仍可为民.如果过了限定时间仍不投降,则由白杆兵坚决予以剿灭.
三,四川,贵州因为兵灾,不但免除一年的所有赋役,朱由检还从内帑银中拨出一百万两,专门用于赈济灾民,恢复生产,重建家园.
四,对于各土司温言抚慰,包括起兵叛乱的永宁土司与水西土司.将叛乱之罪归于安邦彦和奢崇明二人,不株连其家人,.[,！]更不迁怒于彝族百姓.对战死的叛军妥善安葬,其家人如果生活困难,亦可由毕节知府酌情赈济.
五,秦兵立即班师.因为也没有别的路好走,只能原路返回.朱由检在圣旨中特意吩咐,一定要对李定国等身患疟疾的将士精心照料,其余将士也要严防蚊虫叮咬,并且也借着这道圣旨告诉天下百姓:疟疾是由蚊虫叮咬传播的,所以一定要注意防蚊灭蚊.
如果一切顺利的话,秦兵一个月之内就可以返回京师了.但是朱由检总觉得有些心惊肉跳,种种蛛丝马迹显示,近期可能又要有惊天动地的大事发生！