电影的最终效果是日军的三架轰炸机呼啸着从空中掠过，中国守军的高射炮阵地马上猛烈开炮射击。其中一个高射炮阵地就在山坡下，距离拉贝他们只有几十米远，可以清楚的看到曳光弹冲上天空。但这些内容现在是看不到的，必须通过特效来完成。
不过正因为需要添加特效，这个几个镜头不光要考虑表演的问题，而且还要考虑特效添加之后的效果。每个镜头拍完，特效组都会进行简单的合成，把特效镜头合出来给张然，让张然确认是不是他想要的效果。因此，这几个镜头拍得比较慢，拍了一个半小时才拍好。
在这几个镜头拍好后，接下来继续拍拉贝和龙上校的对话。这部分戏涉及到山下的难民，需要动用群众演员。副导演在接到张然的通知后，马上让早已化好妆，等候多时的群众演员为拍摄做准备。同时，几十辆各式老汽车也都开到了指定地点，准备拍摄。
在第一副导演确认各小组都准备好了后，张然开始发令：“汽车开动，30秒准备！”、“录音机开动！”、“开机！”、“打板！”、“群众演员走动！”、“开始！”
随着张然“开始”的口令响起，拉贝他们四个从地上爬了起来。施佩林拍拍身上的土，满是遗憾地道：“真可惜！炮火都打偏了。”
“应当说，幸运的是炮火打偏了！”拉贝脸色十分难看，转头看着龙应钦道，“要是日机发现安全区内有高射炮阵地，进行炮击和轰炸，这无异于一场血腥的大屠杀！”
龙应钦强调道：“士兵要保卫内城，必须把这里辟作战场。”
拉贝质问龙应钦：“中国方面早在11月22日就已经正式承认了安全区，我们是在中方接受了安全区后，才将这方面情况通知日方的。如果日方知道安全区有军队，会毫不留情地对我们进行轰炸，安全区就变成了一个巨大的危险区！”
龙应钦反驳道：“我们也不希望如此，但仗打到这个份上，也顾不上其他的了！”
拉贝终于怒了，大声吼道：“我不干了，这个主席我没法当！我将致电元首希特勒，由于唐将军不守信用，安全区将无法继续存在！”
施佩林拉了拉贝一下，指着山下密密麻麻，像蚂蚁群一般的难民，对龙应钦道：“现在大量难民正往安全区涌，加上安全区本来的人口，整个安全区已经有十多万人！这么人集中在这个区域，如果日军飞机来轰炸，会有多少人死亡？他们是你的同胞，你于心何忍！”
龙应钦眼中闪过悲哀之色，叹了口气道：“两位先生，我们只是执行命令。”
拉贝也知道这事龙应钦作了主，叹了口气，对施佩林道：“走吧，跟他们说也没用，我们还是直接找唐生智抗议！”说完，心急如焚的拉贝拉着施佩林向山下走去。
“停！大家都演得不错，我们再来一遍！”
在场的四位演员都是非常专业的演员，表演水准都非常高，不过张然不给任何人一条就过的机会，每个镜头至少要拍三遍。第一条是熟悉状态，第二条实拍，第三条是为了给后期提供更多素材保险起见再拍一次。这个镜头也是如此，拍了三遍，张然才宣布通过。
接下来的戏是拉贝他们从山上下来，前往卫戍司令部，在途中遇到韩湘琳组织车队，从车外运粮食回来；拉贝与韩湘琳对话，询问城外的情况的戏。
韩湘琳是拉贝的秘书，在中，拉贝秘书被描述成了汉奸，最后日军杀死了。历史上的韩湘琳非但不是汉奸，而且是真正的英雄。韩湘琳被拉贝任命为安全区粮食委员会主任后，很快组织了一支车队，冒着炮火从城外运回了大量的粮食、煤和食盐。正是这些粮食，在后来救活了无数难民。
在拉贝离开南京后，韩湘琳一直留在小粉桥1号，继续解救难民。抗战结束后，韩湘琳还出庭作证指控日军的暴行，著有。陆钏将这样一个人抹黑成汉奸，真的是非常可耻的！
这部电影南京大屠杀部分的主角是拉贝和魏特琳，但张然还是希望拍出中国人的抗争和自救，而不是沦为拉贝和魏特琳的背景板，所以，他安排了韩湘琳和程瑞芳这些角色出场。
张然看了看时间，现在已经四点半，与韩湘琳相遇这场戏涉及到车辆和大量群众演员的调度，需要时间来准备，今天肯定拍不完了。张然便站起来大声宣布：“今天就拍到这里！大家都辛苦了！大家早点回去休息，我们明天继续！”说完，他带头鼓掌。
现场工作人员也都跟着拍手，整个现场掌声一片。