彼时，萧启江部湘军于九月四日抵达，正因太平军已经开始撤退，湘军(包括萧启江部和稍早到达的柳州援军)急欲有所建树，才会轻敌冒进，连基本情况都没摸清楚就急于进攻，结果“因地势生疏，中贼地雷，伤亡弁勇竟至五百余名之多”。
而至九月九日，刘长佑率领的第二路湘军援军终于赶到桂林，这时太平军或早已全军离去，或尚余断后部队，见湘军援军续至，便向南撤退，与主力会合去了。
撤离桂林之后，石达开又将目标放在广西腹地的庆远。
庆远在军事上有着十足重要的意义，为了它当初的当地反清武装与清军还好好的争斗了一番。
1857年9月，大成国反清武装曾经占领这座重镇，1958年又被蒋益澧所率部湘军攻陷。
石达开挥军庆远后，势如迅雷，附近清军纷纷溃败，太平军于1859年10月15日轻而易举地夺下这个桂北的重要立足。
接着，太平军又出兵廓清庆远外围，从庆远东北的罗城一直到柳城以西的落墨渡，筑连营二百里，“逐日操练士卒。”
与此同时，又派军分别占领迁江，北泗，溯河，德胜，柳江，思恩等地，在各据征集粮草，暂时保障了大军的粮草供给。
当时,广西境内反清武装很多，清军力量相对较为薄弱，顾此失彼，正如清廷上谕所言，“粤西连年被贼，兵饷两绌。”
而石达开在宝庆会战失利后深感部队新兵太多，战斗力不强，因此决定在广西一面整训部队，一面等待时机，再图入川。
石达开原本可能想战局柳州为根据地，但太平军进入广西后柳州已被天地会武装占有，石达开不愿与友军相冲突，于是将临时根据地选在了庆远府。
这里与柳州相距很近，互为唇齿，柳州可为其军事屏障，自庆远向北可以进入贵州，向西可经百色至云南，向东可以出桂林入湖南，是一座进可攻，退可守的军事要冲，并且对石达开而言，它还有一个特殊意义：无论经贵州，云南，还是湖南，都可以进入他的最终目的地----四川。
因此，石达开选中庆远作为休整的根据地，可以是经过精心考虑的。
石达开回师广西之际，正是广西的抗清局势日益转向低潮之时。自1850年至1857年，广西原有清军多追击太平军北上，境内空虚，反清武装四起，反清局势一片兴旺。
但自1858年以后，一方面清廷调湘军入粤进剿，形势出现恶化，部份反清武装首领发生动摇，出现投敌叛变的情况。
另一方面，“自一八四五年以后，广西便掀起了反清运动，天天破坏，大家都不注意生产，中间经过十几年的战争，城市既多破坏，农村则一片荒芜。”
广西人民群众的厌战情绪日重，加之反清武装人员良莠不齐，一些部队纪律不严，更影响了民众对反清活动的支持。
因此，到了1859年，整个广西的反清局势，几乎到了土崩瓦解的地步，而石达开的回桂，则无异于给日益削弱的广西反清力量加了一副兴奋剂，打了一个强心针。
石达开占领庆远后，军纪严明，秋毫无犯，一方面打击豪绅，安抚百姓，一方面将部份征集的粮食分发给贫困民众，同时，石达开远征军一向有在力所能及的范围内帮助群众恢复生产的传统。
在石达开远征军占领庆远府期间，石达开经常率部署视察民情，替百姓排忧解难，当地秩序安定，生产得到初步恢复，给其部继续作战提供的牢固的后勤支援。
在短短几个月时间里，太平军人数就从十万人左右扩充到二十多万，当时整个广西反清形势处于低潮，民众厌战情绪弥漫，石达开所部太平军反而得以迅速壮大，可见其深得民心。
然而，广西本来就比较贫瘠，要筹措十多万军队的给养是件十分困难的事。
特别是，随着广西境内反清武装四起，相应的地主团练也纷纷而起，广西境内可以是团练遍布。
这些团练虽对太平军构不成重大威胁，但他们的破坏和骚扰却严重影响太平军的获取给养，尤其是一些团练不惜采取“坚壁清野”的政策，迁走百姓，烧毁粮食，企图以此使各反清武装力量无法立足。
而最为棘手的是，这些地主团练所把守得寨垒中，往往混有很多普通百姓，特别是老幼妇孺，因而使得太平军在剿平地主武装时，每每投鼠忌器，进退两难。
看到这些情报吴可暗暗松了口气，石达开部太平军到这这时，却是陷入了有史以来最为见那的时候，想要再像之前那般搅风搅雨却是难之又难，不用担心他们跟金陵太平军遥相呼应闹出什么妖蛾子来……