好在，项绍宽这份军报并不是请示杭州军机处的意见，只是将前线的态势通报给毛渊明知道，接下去的进程完全是项绍宽、蒋一正、姜承志等人和刘国轩、陈永华商议之后自行决定。
在如何处理耿精忠的问题上，刘国轩表示可战可抚，并无特别的倾向，战则必能胜之，抚也不失为一策。蒋一正、姜承志和陈永华都倾向于优先招抚，可以同意保留耿精忠的王爵，但对于保留兵力一事，蒋一正和陈永华认为不能对耿精忠过于宽容，如果耿精忠手头有兵，迟早又会叛乱。姜承志则觉得，如果不同意耿精忠保留兵力，耿精忠未必肯归降，而且对同时进行的招抚马九玉的工作非常不利。
最后，几人商议出一个折衷方案，作为最后通牒，让耿精忠派来的使者带回给耿精忠。招抚的方案是：朝廷册封耿精忠为顺郡王，耿精忠所部文武官员除曾养性、朱飞熊等外，仍准在王府任职，军队经由点算整编后，准予保留；任命曾养性为都督同知，册封三等伯，朱飞熊为都督佥事，册封三等子爵，曾养性所部军队及朱飞熊所部之水师，经由点算整编后，亦准予保留。
条件不算苛刻，也不算太宽容。站在耿精忠的角度，能够活命，保留王爵、属官和军队，当然比死掉强，但手下的三大主力，白显忠已经降清，马九玉招呼不应，曾养性所部又要另册整编不再属于自己，那么其实也就等于只剩下两、三千没有什么战斗力的部队，仅能看家护院而已，自己将从权势滔天的靖南王，变成一个富家翁。
但事已至此，容不得耿精忠再犹豫，坐在福州城中，已经能听到明军的炮火声。更重要的是，明军单独开出了对曾养性和朱飞熊的招抚条件，如果自己不答应，难保曾养性不会拿自己的人头去换取更好的待遇。
十一月初八正午，耿精忠打开城门，向明军献降。为了安抚耿精忠，姜承志提前派遣使者告诉耿精忠，不需要面缚肉袒，也不需要抬棺，只要免冠徒步出城，缴纳清朝赐给的金册印信即可。
招讨副将军郑克臧作为大明皇帝的代表，接受耿精忠的献降，然后由蒋一正和陈永华带兵进城，接手防务，并且接收官衙的各种文书簿册。郑克臧和项绍宽则在城外营中设宴，款待耿精忠以及手下的官员。
刘国轩带兵监视曾养性向城南移营，并且负责清点整编曾养性和朱飞熊的军队。作为一个军阀气息浓郁的将军，曾养性当然非常反感自己的军队被别人清点整编，但一来战场局势近乎绝望，二来项绍宽承诺清点整编只是为了清理空额登记造册，绝不调走他的一兵一卒，曾养性因此也只能选择忍耐。至于朱飞熊，就没有那么好的待遇了，手下的战船和士兵被丘辉、江胜划走了不少。
清点整编的结果，耿精忠亲随的军队名义上有三千二百多人，实际上连空额带逃跑出缺再扣除投降之后不愿继续当兵的，实际只剩下一千八百人。项绍宽下令把这一千八百人整编为三个警卫营加上一个仪卫司，仍归耿精忠自己掌管。但投降条件中，并未写明武器配备等事项，因此项绍宽收走了耿军仅余的二十多门火炮，火枪也仅给耿精忠留了三百条。耿精忠虽然心里不满意，但也不敢出声。
曾养性的部下倒还有九千多人，空额不多，装备也颇为齐全，显得曾养性带兵还确实有两下子。清点之后，项绍宽命令曾养性就地休整，等候命令。