罢免陈松昌当天，同泰帝将赵松寿叫到养德殿密谈了将近一个时辰。而后，同泰帝下旨由副宰相赵松寿会同刑部尚书师道全、大理寺卿周做会彻查陈松昌一案。赵松寿领旨后，立即派师道全赴西北调查拿问一干涉案人员；派周做会在京城逮捕陈松昌的多位亲族、旧部，并严格审问。
在短短几天时间里，许多不利于陈松昌的证据汇集到了赵松寿处。原大都督府的下属，为了自保，也纷纷出首自己的老长官。一些见风使舵的言官、御史也开始根据传闻上书，弹劾陈松昌及其故旧。皇帝对陈松昌的处置由开始的回府居住；改成禁军守卫、限制出入；又改成严格监管、禁止出入。到了腊月中旬，随着刑部尚书师道全将身在陕西的陈松明、陈松骏、黄清顺、郭嘉生等人逮捕入京，陈松昌案件的严重性陡然上升。其中，郭嘉生的证词对陈松昌最为致命。他说陈松昌在去年抗击西羌的过程中，多次违旨，还派出使节向西羌求和，意图割据一方；他又说陈松昌不救友军，蔑视监军，杀良冒功，激起民变……因为郭嘉生长期担任陈松昌的副将，又控制着四万西北边防军，他的证言被上报后，同泰帝震怒，立即召见了王克明、赵松寿、冯体仁、张文辉和刘睿五人。
同泰帝难过地说：“朕实不愿处置陈松昌，但越来越多的证据表明，这个人危害到了国家社稷。你们也许知道，也许不知道，陈松昌早些年一直把朕当成小孩子看待。即使朕已经登基，他仍然对朕缺少敬畏之心。他的大哥陈松明仗着他的势力做到了绥州镇守使，在军队里卖官鬻爵，贪污腐败，在地方上盘剥百姓，生活奢靡。他的二哥陈松骏利用为西北筹办粮饷的机会，侵吞了国库一百多万两银绢，并将其中三十万两送给陈松昌，替自己买通关节。陈松昌本人在西北作战时，先从国库里领取了二百万两军费，可转身就拉回了自己府中，用于前线作战的银子连五十万两都不到。他为了独占功劳，让四川兵马突前，可又不及时接应，造成我朝一路大军被西羌围歼。在拿下陇县后，因进兵迟缓，致使西羌主力逃脱。为了凑人头，他下令屠尽县内百姓，激起了民变。”同泰帝越说越激动。他拍案而起道：“最为可恨的是，他在对西羌作战结束后，滞留西北，联络省府，欲图分疆自立。后因朕击败了柔然，平定了北方，他看无机可乘，才被迫回京。你们说，对这种忘恩负义、图谋不轨的小人，朕应怎样处置？”王克明因有把柄在同泰帝手中，听了皇上的话，第一个表态说：“应用极刑，以正国法。”赵松寿也说：“据臣所查，此人确实罪大恶极，应明正典刑，以儆效尤。”刘睿紧接着说道：“臣赞同二位相国的提议。”张文辉是最了解陈松昌的。他不相信陈松昌真的十恶不赦，但他又不敢明着为陈松昌开脱。他轻轻咬了一下嘴唇，缓缓说道：“陛下，现在就判定罪责，似乎有些仓促，可否继续调查，待过年之后，证据确凿，再做裁处？”见同泰帝不置可否，冯体仁大概领会了皇帝的意图。他向上扣头说：“皇上，陈松昌犯下了不赦之罪，按律是要诛九族的，可吾皇宅心仁厚，不忍灭其满门，这份天子仁心，令臣感动。臣恭请陛下先将陈松昌的罪行昭告天下，判其重罪。而后，陛下再以陈松昌曾为朝廷立过功勋为由，特旨对其减等处罚。这样既可震慑心怀不轨者，又可彰显陛下宽仁爱民之心。”同泰帝点点头说：“冯相言之有理，你们就按这个意思商量着拟旨吧。记住，朕做事就是要让天下人心服。”
腊月二十三，天上飘着点点雪花。时近中午，赵松寿捧着圣旨昂首走进了大都督府。当跪伏在地的陈松昌听到自己被赐自尽的时候，他挣扎着站起来，高声喊叫着：“皇上，臣要面见皇上！臣要见皇上！臣冤枉，臣有话说啊！”赵松寿冷冷地说：“可皇上并不想见你。陈大都督，不就是个死吗。你在战场上拼杀多年，还怕这个不成。”陈松昌亢声说道：“可我不能背负着谋反的骂名呀！我是忠于大周朝的呀！”赵松寿说：“皇上已经减了你的罪，对你的家人也只是流配边城。你应该谢恩才是。”见陈松昌一直大喊大叫，不肯接旨，赵松寿随骂道：“看来，你也是怂包一个！”他把手一挥，示意禁军动手。跟在他身后的四名军将立即扑过去，架着陈松昌就往堂屋里拽。赵松寿跟在后面补充说道：“皇上恩典，赏他全尸。用白绫勒死好了。”片刻之后，赵松寿一边命令刑部的人验尸装殓，一边指挥着禁军抄没大都督府。
正月初一朝会，按照惯例，凡在京七品以上官员都要到宣德殿外，向皇帝叩贺新春。寅正刚过，翰林院掌院学士就带着全体侍讲和翰林在宣德门外列队守候了。卯初，宣德门开放，官员们按照官阶次序进入了殿前广场。由于是冬天，又是在户外，北风刮在人身上，象刀割一般疼。官员们一个个被冻得瑟瑟发抖。新晋翰林蒋清合已经四十多岁了，身体孱弱，本就有咳喘的毛病，在寒地里又冻了这么久，眼前发黑，身子发软，一头昏死在地上。跪在旁边的翰林们赶紧把他扶起来，拍打呼唤。宋启愚看了看蒋清合的脸色，摸出一个小药瓶，拔出塞子，抱着蒋清合给他灌了几口。宋启愚对众人说：“他是受了寒，喝下药，休息一会儿能缓过来的。等下了朝，再调理调理就没事了。”果然，蒋清合喝药之后，很快就醒了。他一边拱手一边说：“麻烦列位了，我没事。时辰快到了。大家回去，跪迎圣驾吧。”说着，他便再次郑重地整理好衣冠，跪地等候了。
卯正时分，同泰帝穿着整套冠冕，摆着全副仪仗，威风凛凛地来到宣德殿。群臣尤其是低品次臣僚们个个心情激动。他们三跪九叩，山呼万岁。皇帝升坐后，高声说：“众卿平身。赐新年贺词。”白晨双手捧着一道诏旨，送到跪在御阶下的王克明和张文辉手上。王、张二人向皇上磕头后，转过身来，朗声读到：“吾皇继位，振兴朝纲。奏凯柔然，平定北方。远夷归化，太平中央。为民安乐，减债安邦。五谷丰登，九州同旺。开科取士，干吏封疆。清除奸邪，魑魅震惶。……睿智天子，皇朝永享！”读完新年贺词，百官向天子再次行了三跪九叩首大礼。同泰帝宣布退朝，并在乐曲声中走下了金殿。贺岁大典顺利完成。
按照钦天监测定的时辰，同泰帝命令白晨将贺岁诏书分赐各部，以示皇家受命于天和光明正大。白晨先派出几十名太监去往他处，而他自己则带了一份召旨往翰林院颁赐。翰林院的一众官员听说来使是大太监白晨，以掌院学士为首的所有人急急出了登瀛门前来迎接。官员们一个个笑颜如花，恭敬至极。白晨也不多言，大模大样地走进正门，穿过讲习堂和过厅，最后将圣旨供奉于内堂之中。期间，翰林们不断向白公公献殷勤。白晨也只是点头致意，偶做应答。当白晨离开翰林院的时候，全体翰林更是跪送公公出门。
白晨刚要登车离开，从街口走来几个七品服色的官员，为首的正是宋启愚。原来啊，由于蒋清合在散朝后身体支撑不住，宋启愚和童道生、朱昌海、冯肖文、金杰等几名翰林便请示了掌院学士，先送蒋清合回府修养，再回翰林院当差，故而迟到。宋启愚见钦使是白晨，赶忙深施一躬，退到了路旁。朱昌海本欲下跪，金杰小声说：“按朝廷规矩，钦使宣旨完毕，官员不应下跪。我们该按宣道的礼数晋见。”于是，几名翰林也长躬让路见过了白晨。白晨从车上下来，还了几位翰林一躬，笑着说：“宋大人，几位大人，新年好哇。”翰林们赶紧也还礼，答说：“白公公新年好。”白晨又对宋启愚一拱手说：“宋大人，皇上有话让咱家单独问你。其余官民回避。”童道生等人不敢抗旨，赶紧拱手别过白晨回翰林院去了。