我继续讲，当邪恶博士妄图称霸世界的阴谋被马克教授知道后，他们两人在数码世界中发生了一场大战，最后，邪恶博士实力过于强大，马克准备不足，不幸败下阵来，还好最后能够逃出邪恶博士的追杀，在返回真实世界的路上，被邪恶博士暗中在马克身上种下的小程序封禁了起来，意识无法回到真实世界，最后无奈，只好选择被写入数码世界，而导致马克教授肉身死亡，现在马克的意识还在数码世界当中。”
马克还活着，而且变成了数码人。
这个消息，令杨立十分震惊，到目前为止，他只见过莉莉一个数码人，十分确定的是，这场阴谋已经进行了很久，不过整个世界的人却都被矇在鼓里，包括十多年来一直在网络上游荡的他，正像克泽尔说过的那样，也许自己有一天死了，都不知道是怎么死的，另外，这个阴谋是由邪恶博士设计的话，那么这个世界就更危险了，因为邪恶博士就是“邪恶联盟”的创始人，他手中同样握有“上帝之手”。
“现在，现实世界中，有多少人知道网络中有数码世界的秘密？”杨立看了看盘旋在石柱上，虎视眈眈看着他的两条黑蛇，问道。
全身被白光包围着的小精灵尼奥，飞回到杨立面前，在黑色的空中留下一条美丽的轨迹。
“除了邪恶博士的人外，在世界上，我不知道还有谁知道这个秘密。”
对这个回答，杨立并不感到意外，以他的计算机水平，倘且不知道这个隐藏在网络上的秘密，这个秘密隐藏得太深了。
“你为什么知道这么多？”
“因为我是马克制造出来的，三年来我一直陪伴在马克身边。”
“你为什么不把这个秘密告诉实验室的研究员？让他们提前做好防范。”
“数码世界跟外界的连接口都是单向连接的，也就是，数据只能从外界流入数码世界，而不能从数码世界流出外界的网络。就像你在上次在游戏世界中遇到的单向传送门。”
“你知道我的事？”
杨立十分惊讶，现在的尼奥好像无所不知。
“那次实验室遭他入侵的事件，正是邪恶博士的人干的，他入侵的目的，是想找出马克是否隐藏在实验室的电脑系统中，那次你们与入侵者之间爆发的恐龙大战，我和马克就在旁边看着，事实上你和克泽尔那次是完全没有活着的机会，敌人远远要比玛丽三人强大，而且还在他们的游戏主场，直接全力对战，你们获胜的机会为零。”
尼奥飞到杨立面前，晶莹剔透的大眼睛看着杨立。
尼奥发光的身子就像是黑夜中一盏明亮的灯，在杨立的黑色眼瞳中映照着，就像一团点燃的火焰。
尼奥继续说道，“你们能活着从游戏世界中出来，是因为有人为你们求情，那个叫托尼（Tony）的男子，是邪恶博士的孙子，他从很久以前开始，就深深地爱上了莉莉，在莉莉出车祸后，他不惜和他的爷爷邪恶博士争吵起来，因为他要他爷爷帮他把将要死去的莉莉写入数码世界。而邪恶博士以技术还不成熟，把莉莉写进计算机，可能会变成怪人为由，拒绝了托尼的请求，而托尼却不肯放弃，最后，托尼答应他爷爷，他愿意用自己的自由为代价，一旦邪恶博士同意把莉莉写进计算机，他愿意用生命做为代价帮助邪恶博士完成统治全人类的梦想，终于，他爷爷答应托尼的请求。实事上，在车祸事故中，莉莉并没有应即死亡，她在被救护到医院中时，还有气息，不过，她受的伤害太重，已经无法救治了。邪恶博士和托尼就在夜里，进入医院，把将要死亡的莉莉写进了计算机中。不过，由于邪恶博士手中的‘电脑人’技术还未成熟，莉莉在被写进计算机后，几乎失去了所有在真实世界上的记忆。”
“邪恶博士是谁？”
“不知道，他的身份很隐密。”
“你们怎么会知道得这么多。”
“那天，马克教授在研究网络，突然发现一块奇异的现象，在网络中，有一块停滞在网络传输光缆中的信息，你知道的，网络中所有的信息都是在流动的，信息在不同的机器间流动，通过光缆进行传播，不可能有停滞不动的信息存在。
马克在发现这个怪现象后，他冒险用虚拟机进入网络观察，然而马克一进入数码世界，就遭遇到邪恶博士，马克与他进行了一场大战，不幸失利，但他成功摆脱了邪恶博士的追踪，然而，邪恶博士在他身上种下的一个小程序，把马克牢牢封在一个小程序中，那个小程序，被邪恶博士进行过复杂的加密，只有他才能打得开。
由于马克使用的是虚拟机，他的大脑意识若无法回到真实世界的肉体中，他的肉体就会死亡，而数码世界中的马克的意识也会在世上消失。
无奈，马克只好启动实验室中的‘电脑人’技术程序，把自己写进了计算机网络中，也就是我们现在身处的这个数码世界。
实验室中，还隐藏着一个秘密，事实上，在三年前，‘电脑人’技术就已经成熟了，能够把人脑中的所有信息都下载下来，放到电脑中，并被可视化读取实验者的所有记忆，使用者能够观看被读取人的任何信息，一切的信息，从出生到被读取时。
同时，通过‘电脑人’技术衍生出来的另一项功能也已经成熟，那就是，把人完整地写进数码世界，不会有人体信息遗漏，不会发生像莉莉身上发生的记忆消失，那是一个完全成熟的技术。
不过，政府为了保密，以至于引起世界各国的安全恐慌，要求马克教授协助保守这个秘密，担心‘电脑人’技术全世界都已经知道，别国可能会在实验室中放有间谍，政府也瞒着所有研究人员，在整个实验室中，只有马克知道‘电脑人’技术已经完成的秘密，即使连西蒙教授也不知道。每次在进行关键技术的完整性实验室中，上头都会派专人在实验中作手脚，所以这个秘密，三年来一直被保守得很好。
马克在与邪恶博士的战斗过后，发现邪恶博士对‘电脑人’技术十分熟悉，所以他猜测，邪恶博士很可能一直在窃取‘电脑人’技术，他秘密侵入实验室系统，把实验成果窃走了，然后他在世界的一个隐蔽的地方，也建造了‘电脑人’机器设备，他就是靠这套设备，策划在网络中建造一个数码世界，有可能企图有一天把所有人类都写进数码世界，或者用别的方式，来达到称霸世界的目的。
战斗过后，邪恶博士就制造了现在你面前的这些关卡，把进入数码世界的路都封死了，这也是我为什么不能够把信息带给大家原因，我根本就无法离开这里，在房间中的那个精灵，其实是以前进入数码世界之前的我。
虽然现在我们身处数码世界，但不过是在数码世界与真实世界的交界处，也就是前面这条红线之后，过了这条红线，两条蛇都会消失，而我们只有踏过这条红线，才算是进入真正的数码世界。
我们之所以还不知道邪恶博士在真实世界中的身份，是因为虽然马克与邪恶博士有过一战，见过邪恶博士的长像，他已经修改了自己的长像，与真实世界中的已经不同，即使看到他，也无法查到他的身份。
再后来马克在与他的战斗中失利，而被封住无法移动，那时我一直跟在马克身边，马克就派我到数码世界中侦察邪恶博士的举动，我无意中进入了托尼为莉莉建造的数码大陆中，也就是你们发生恐龙大战的那块大陆，我悄悄隐藏在托尼身边，花费许多力气才听到的这些消息。
另外，你们无意中闯入了托尼为莉莉建造的世界中，他很生气，想把你和克泽尔都杀掉，但莉莉在他身边为你们求情，而且看在你为莉莉挡住那块意外飞向莉莉的木板份上，他答应莉莉给你们一个机会，不全力出手，看你们能否在半个小时内回到金字塔内的传送门中，就在你为了救克泽尔而晕倒后，托尼一直有机会杀死你们两人，但看在莉莉的份上，他放过了你们两人，他一直不出击，直到纳什很快操纵恐龙赶到，救了你们两人。”
杨立听得越来越震惊，他脑中又回忆起那场惊天动地的恐龙大战，原来，一切竟已都在敌人地掌控之中，这让他觉得很不是滋味，一种被玩弄的气愤感涌上心头。
“哼。”杨立冷冷道。
“别小瞧他们，邪恶博士拥有许多高科技设备，而且隐藏在暗中，很不易对付。”
“马克教授有没有想过怎么对付邪恶博士？”
“是的，马克教授还有很多事要告诉你，不过你先得通过这些关卡，你才能见到他。”尼奥用短短的小手指着前面那扇山峰一般宏伟的大铁门，说道，
“这些关卡一共有五关，有点类似于你玩的游戏，然而事实上并非如此，这些关卡，与你玩过的那几个小游戏，没有任何关联，如果有联系，那也是碰巧而已。”
“那么我应该怎么做？”杨立感觉自己对这个世界了解得太少，干脆把让尼奥指引自己。
杨立这样做是对的，因为尼奥原来就是马克用来指引无意中闯入这个数码世界中的外人的，从而增加对抗邪恶博士的力量，这些事情，尼奥自然不会跟杨立说。
“你要把这两条黑蛇打败，取到它们头顶上的钥匙，然后把铁门打开，你才能通过这扇大门，进入下一关。”
听起来似乎很容易，操作起来却绝非如此。