宗时还设置“京朝官差遣院”，负责对少卿监以下京朝官注拟差遣。淳化四年（公993年）也并入审官院。神宗熙宁三年（公1070年），设置审官院，主武臣阁门祗候以上到诸司使等的磨勘、注拟差遣等事。又审官院为审官东院，主文臣京朝官以下考核功过、叙其爵秩、注拟差遣等事。两院各派院、同院各1员、主簿2员。丰五年（公1082年），作为全面革官制措施之一，是铨注之法全归吏部，撤销审官东院而为吏部尚书左选、主寄禄官在京朝官和职非中书授的文臣；撤销内铨而为吏部侍郎左选，主从初到选人的文臣；撤销审官院而为吏部尚书右选，主升朝官以上和职非枢密院授的武臣；撤销三班院而为吏部侍郎右选，主副尉以上到从义郎的武臣。
《宋·职官三》载，从此以后，以上文、武官员的选试、注拟、责、升迁、叙、荫补、考课的政令以封爵、策勋、赏罚、殿最的制度，都归吏部掌。吏部的长官为吏部尚书，设一员，副长官为吏部侍郎，其下有郎中、员外郎各二员，分尚书左、右选和侍郎左、右选。此外，还有司封、司勋、考功的郎中和员外郎各两员，官告院主官一员等。
户部
宋初设三司总全国财政，户部几乎无所职掌，只派“判户部事”一员，各地土贡，至时陈于殿廷。神宗官制革时，撤销三司，全国财计始归户部。户部主全国户籍、土地、钱谷的政令以贡赋、征役等事。设户部尚书一员，左、右曹侍郎各一员。郎中、员外郎各二员，度支、金部、仓部各二员。左曹分户籍、税赋、土贡、征榷等事，右曹分常平、免役、甲、义仓等事。度支掌全国财政预，量入而出；金部掌全国的货币支，藏于库；仓部掌仓库贮积和支等事。
礼部
宋初设常寺礼院。宗时又设礼仪院，主礼仪之事。礼部只派“判礼部事”一员，掌举，奏补庙斋郎等事。神宗时，撤销常礼院，其职权划归礼部。礼部设尚书、侍郎各一员，郎中、员外郎各一员。礼部下设祠部、主客、膳部等三司。掌礼乐、祭祀、朝会、宴享、学校、举之政令。
兵部
宋初设枢密院，掌军事政令，武臣铨选则归三班院和审官院负责，兵部只皇帝仪仗、卤簿、武举、义勇弓箭手等事，“判兵部事”一员。神宗时设兵部尚书、侍郎各一员，职方、驾部、库部和本部等四司郎中、员外郎各一员，职权略有扩大，主民兵、弓手、厢军、蕃兵、剩员，武士校试武艺，少数民族官封承袭等事。
刑部
宋初刑部是最高司法机构之一，主全国刑政，并审大理寺所定大辟案。宗时，创设审刑院，将刑部审权拨归审刑院，审刑院成为全国另一最高司法机构。神宗时，撤销审刑院以纠察在京刑狱司，将其审等权归还刑部，从此，刑部的职权大为扩大，主全国刑法、狱讼、奏谳、赦宥、叙等事。设刑部尚书一员，侍郎二员；郎中和员外郎，本部各二员，都官、比部、司门等司各一员。本部郎中和员外郎，又分左、右两厅，厅各二员，左厅掌详，右厅掌叙雪。
工部
宋初只设“判工部事”一员，所属屯田、虞部、水部的职权全划归“三司”，工部职权很少。神宗官制革时撤销“三司”，工部恢职权。设工部尚书、侍郎各一员，本部和屯田、虞部、水部四司郎中、员外郎各一员，主全国城郭、宫室、舟车、械、钱币、河渠等政令。宋时，将军监和都水监并归工部，工部的职权就为扩大了。工部还兼军所和文院；高宗时还设立制御前军所，提点官二员和提辖、监官各若干员，负责制武；文院负责制金银、犀玉等物，设提辖官一员、监官三员。