但是“顾问”历来都不是一个专门的官职，而且他们的身份也是皇帝的侍臣：严格来说，指的就是他们是皇帝的私臣，而不是政府的大臣。但很显然，皇帝想设立的这个顾问机构是政府的官方机构，而不是仅仅服务于皇帝本身的。这让大臣感到很是不解。
不过也正是因为他们的不了解，导致了大多数人并没有阻止的意愿。所以大臣、御史们上书反对的理由也大多是不符合祖制罢了，于是三月二十九日，在朱由校的坚持之下，内阁通过了这份草案，大明枢密院正式成立了。
此时的大臣们还并不知道，他们的大意导致了他们已经错过了掐灭改革萌芽的最佳时机。
世界并不是静止的。你会进步，别人也会进步。大明正在进步着，后金也同样如此。
大明天启二年（伪金天命七年）三月十八日，后金水军成立了。20多艘新刀船，在奴隶主的皮鞭之下由奴隶工匠飞速的建造了出来，停靠在大凌河沿岸。
刀船只是一种内河航运用的小船，一般为商人运货使用，与战舰相距甚远。
但大明的水军经常从三岔河河口进入，对后金沿岸两地进行骚扰，而完全没有海军力量的后金，只能干瞪眼。
而现在，这几条新到船当然不足以去主动向明朝的水师发动进攻，但是封锁河口已经够用了一一大不了自沉么；当然，其实后金也并不是没有想过建立自己的海军力量，毕竟营口这做条件优良的港口现在就在他们手中。但他们既没有足够的技术，又缺乏专业的人才，再加上明朝海军不断的登陆袭扰，看着自己的半成品战舰，一次又一次的被烧成了木炭，努尔哈赤已经气到了崩溃，只能放弃了这个计划，转而发展内河道水师，并且下达了迁海令，即减少沿海居民与明军的来往，也减少了自己的损失。
朱由校怎么也不会想到，自己的蝴蝶效应竟然会让大清提前好几十年“闭关锁国”。