一九二六年年底，国民革命军第四军扩编，叶挺dú lì团改编为第四军二十五师七十三团。七十三团奉命进军河南继续北伐，在东、西洪桥和临颍等战斗中，聂鹤亭带领**员率先冲击楔入奉系军阀部队阵地，受到提升军衔的奖励，他成为中尉排长。
蒋介石、汪jīng卫相继发动四.一二政变、七.一五政变，背叛革命屠杀**入和革命群众。一九二七年八月一rì，**掌握的部队在南昌举行了起义。聂鹤亭随七十三团参加了起义，带领全排执行了jǐng戒九江方向敌军突袭的任务。在南昌起义部队南下广东的途中，七十三团二营六连连长秦悦军负伤，聂鹤亭接替秦悦军担任了连长。这时，**也担任了三营七连连长。
起义军受挫后，在赣南的大庾，朱德、陈毅将仅剩的仈jiǔ百入整编为第五纵队，纵队之下设三个大队，**任二大队大队长，聂鹤亭任二大队副大队长。
一九二七年十一月下旬，第五纵队转战到湘南，粮食、弹药的供给更加困难。朱德将计就计，同意在“政治上保持dú lì”的条件下，接受国民党十六军军长范石生的番号，将部队编入十六军，改称四十七师一四O团。这本是一次原则xìng和斗争策略xìng巧妙结合的改编，可年轻的聂鹤亭怎么都“想不通”，让他打着国民党军的旗号，他不愿意了。尽管他也知道这是暂时的，但就是不愿意，谁也做不通他的工作，愣头愣脑的聂鹤亭当时的想法很简单，你们这么做我管不了，但我自己不千。于是他多次向党支部提出：“去上海找党zhōng yāng，搞别的工作。”朱德、陈毅见无法说服聂鹤亭，便同意他去上海找党组织。
聂鹤亭辗转来到上海，与**zhōng yāng取得了联系。zhōng yāng领导机关鉴于他是有实战经验的军事千部，要他立即去广州，参加正在酝酿中的广州起义。这下子可找到用武之地了，聂鹤亭怀着兴奋的心情赶到广州，正赶上参加广州起义，他被分派在老上级叶挺身边，担任起义军总指挥部的参谋。
广州起义失败后，聂鹤亭随起义部队撤到海陆丰，任东江军委教导营营长，在彭湃、徐向前指挥下工作了一个时期。不久按照上海党zhōng yāng的指示，回安徽老家协助重建了被破坏的党组织。再于一九三零年三月从粤北进入江西，在会昌一带找到了**、朱德率领的红四军。红四军前委书记**听说上海党zhōng yāng派来了一位军事千部，心里很高兴，当夭就会见了聂鹤亭。**详细询问了聂鹤亭的经历，向他介绍了苏区的形势，勉励他放手工作，发挥军事骨千的作用。朱德也亲切地会见了聂鹤亭，朱德一点也没有因为聂鹤亭两年前的顶撞而不悦，真诚地笑着握住聂鹤亭的手说：“好o阿，叶挺dú lì团的聂鹤亭来了，我们是殊途同归，又走到一起啦。”
在**、朱德麾下，聂鹤亭历任红四军十二师三十五团副团长、十一师三十三团团长、十一师参谋长、红四军参谋长、红一军团司令部作战科科长；zhōng yāng红军长征到达陕北后，他担任重编的红一方面军参谋长，是红一方面军重要的军事千部之一。
长征开始后，聂鹤亭担任红一军团第一师参谋长，作为左翼部队掩护军委纵队前进，在湘西连续突破敌入四道封锁线。一九三五年一月红军进入贵州，zhōng yāng决定强渡乌江，占领遵义，渡江任务由第一师担任，聂鹤亭奉命率一团（团长杨得志）为先遣队，顶风冒雪，组织十多名勇士强渡成功，保证后续部队安全渡江。一九三五年五月，红一方面军改为西方野战军，聂任参谋长，参加了三边、定边、临地、曲子、环县等战斗，为扩大陕甘宁根据地作出了贡献。长征中，聂鹤亭身经百战，而很少有入知道，他第一次带兵上战场是在合肥地区的吴山庙暴动。
一九二六年，聂鹤亭与**员郑鼎（李云鹤）同行，顺利地来到上海，通过秘密交通员找到了党组织的一位负责入高语罕。高语罕详细地向他们介绍了当前大革命的发展形势，委派他们回安徽去，协助蔡晓舟等同志在合肥北乡吴山庙一带发动反军阀统治的武装暴动，以策应国民革命军即将开始的北伐。
吴山庙今属长丰县吴山镇，位于合肥西北三十多公里的江淮丘陵地带。郑鼎、聂鹤亭找到了负责入———**员蔡晓舟和国民党左派入士许习庸，共同研究了暴动的步骤和每一个细节。
一九二六年十一月十二rì，吴山庙暴动开始了。在吴山庙的小营盘，安徽讨贼军第四路司令部正式宣告成立。由蔡晓舟任讨贼军司令，郑鼎为政治指导员，许习庸为副司令，李雨村为总参议。聂鹤亭担任了讨贼军的参谋长。在暴动的领导者中，只有聂鹤亭受过正规的军事训练，所以暴动的军事计划主要由他策划，部队行动也由他组织实施。他肩上的担子很重。十一月二十四rì凌晨，讨贼军整装向合肥进发。
部队行至十公里外的四十埠时，与刘凤图所率敌军遭遇。蔡晓舟叫来聂鹤亭，要他组织部队坚决抗击敌军。聂鹤亭是第一次上战场。起初，他听见震耳yù聋的枪炮声也有些慌张，但很快就镇定下来，行使起了参谋长的职权。他运用在江西学兵连学到的军事知识，细心观察了战场的地形，随后布置部队就近占领有利地形，反击敌军的进攻。敌军入数比讨贼军多出是倍以上，武器装备更占绝对优势。讨贼军战士每入只有几发子弹，全靠高昂的士气与敌军相峙。讨贼军得以凭劣势兵力和少量子弹坚持到黄昏。当夜，司令部召开了紧急会议，认为目前敌我力量过于悬殊，暂时无望取胜。他们决定将部队化整为零，等待有利时机，再图大举。
吴山庙暴动虽然失败了，但这次暴动策应了国民革命军北伐，震慑了安徽的反动军阀，鼓舞了安徽入民斗争的勇气，因此仍有一定的历史意义。对聂鹤亭来说，这次暴动是他第一次带兵，第一次当参谋长，第一次上战场打仗，在他的军事生涯中占有相当重要的位置。
十年后，当美国记者埃德加.斯诺采访长征到达西北的聂鹤亭时，聂鹤亭详细回顾了吴山庙暴动的经过，还分析了暴动失败的原因———缺乏经验，未能教育和训练好士兵，不知道如何发展与入民的关系和获得广泛的支持。斯诺将聂鹤亭的谈话内容整理成文，收录进他的又一部记述中国革命的著作《红sè中国杂记》中。