七rì，胡琏飞南京向蒋介石报告双堆集情况。8rì晚，蒋介石邀宋希濂、胡琏，蒋经国共进晚餐，并放映电影《文天祥》。蒋对宋、胡说：”这个片子很好。”暗示宋、胡为其政权“效忠”。九rì，胡琏再次飞双堆集，向黄维等传达了蒋介石准许在危急时可以突围的指示。
十二rì，中原、华东野战军对第十二兵团发起总攻。十五rì，黄维突围的命令下达后，所部争先恐后乱成一团，结果除少数漏网者外，悉数被歼。胡琏因害怕当俘虏，在突围前向医务人员要了大量安眠药，准备在不能脱身时，服药自杀。胡后来乘战车冲出了重围，遇到第十八军未被包围的骑兵。不久，他跑到了南京。
一九四九年二月，胡琏被南京国防部任命为第二编练司令部司令，负责收集从长江以北溃败逃至江南的官兵，并补充新兵。第二编练司令部设在江西南城，得到当时的江西省主席方天的许多帮助。不久，便成立、重建和督练第十八军和第十军，由高魁元、刘廉一分别任军长。是年四月，解放军渡江战役打响后，代总统李宗仁要胡琏率部进驻大庾岭，胡对李的命令阳奉yīn违，按兵不动，暗中却接受蒋介石的遥控指挥：五月中旬，南城解放，第二编练司令部改编为第十二兵团，胡琏任司令。
一九四九年七月，**第十二兵团根据胡琏总司令“纵深防御、移动防御”的战略原则开始进行大规模的战略转移，分兵两路南下，成功摆脱了南下大军围歼第十二兵团的战略企图，于七月十四rì从江西进入广东兴宁，在石马镇稍事休整，接着进入梅县；在石马休整期间，兵团总司令胡琏曾在辛亥革命元老、同盟会嘉应州主盟人一一“何子渊故居”光裕庐坐镇指挥部队达五天五夜，后因电话线路多次遭游击队破坏，而匆忙撤离石马。（七月十四rì亦是zhōng yāng军委关于围歼胡琏命令电报发出的第一天。）九月初，胡琏兵团撤往广东cháo汕地区，期间在cháo汕、普宁地区大量抓捕青壮年男子（抓壮丁）以补充死伤溃散的所部军队，旋从海上驻防金门。十月二十五rì，胡琏第十二兵团与李良荣第二十二兵团，在金门西北角的吉宁头村，成功阻挠解放军登陆金门，并取得金门战役的胜利。同年冬，胡琏被委任为福建省主席兼第十二兵团司令。一九五零年初，第十二兵团改为金门防卫军，胡琏任金门防卫军司令兼福建省主席及福建人民**救**总指挥。
一九五一年，胡琏在金门成立“福建省游击队”，后改名为“福建省**救**”，他任总指挥。胡琏曾派遣小股特务潜入福建省，试图进入戴云山区进行**游击活动。但不到一个星期，大陆军民便将这些特务一网打尽。
一九五二年十月，胡琏加授陆军上将衔。
同时，被选为中国国民党“第七届zhōng yāng委员”
；此后，他连任第八、九、十、十一届zhōng yāng委员。
一九五四年六月，胡琏奉调回台北任第一野战军团司令。一九五七年又奉调去金门，再次出任金门防卫司令，一九五七年七月升任二级陆军上将。一九五八年八月二十三rì，福建前线人民解放军炮轰金门，次rì，胡令所部向大磴岛进行炮击。金门炮战持续了四十六天，九月任金门防卫司令部司令兼金门战地政务委员会主任。
一九五八年冬，金门防卫司令由刘安祺接任。胡琏擢升为陆军总司令部副总司令。一九六一年十二月人国防研究院受训。一九6sì年，胡琏出任”驻越南（南越）大使馆大使”，在职八年。一九七二年胡琏被免职回台北，任“总统府”战略顾问，并晋升为一级陆军上将。他晚年爱好文学和历史，研读典籍，喜读古书，一九七四年附读台湾大学历史研究所，研究宋史和现代史。著《古宁头作战经过》、《泛述古宁头之战》、<金门忆1rì》和《越南见闻》等书。一九七七年六月二十二rì，胡琏因患心脏病在台北逝世。
胡琏将军的遗体，后以海葬形式安葬在澎湖列岛海域，实现了其“魂护台澎”的遗愿。
遍览台湾近年之军史著述，不光竭力贬低刘伯承、陈毅、粟裕等大陆将领，而且将张灵甫、李仙洲、邱清泉、黄百韬，黄维等国民党败军之将也说得愚蠢之至粪土一般，唯胡琏超智超勇鹤立鸡群乃千古难觅之良将，似乎蒋公介石如早早委此君以大任，则定能扭转乾坤、挽狂澜于既倒。
平心而论，胡琏在战场上的表现确比其同僚们略高一筹，他有张灵甫的“悍”，但无张灵甫的“骄”：其“忠”不比黄百韬少，其“谋”绝比黄百韬多。台湾史籍广泛传引所谓**给前线部队的一封亲笔函称：“十八军胡琏，狡如狐，勇如虎。宜趋避之，保存实力，待机取胜。”以说明共军对胡琏的畏惧之甚。**是否发过如此信函根本无据可查，但把胡琏喻为“虎xìng”与“狐xìng”的结合体还是恰如其分的。许多三野老人认为，胡琏的整十一师（十八军），综合战力仅略逊于整七十四师，从其几次避免了被歼的命运，而且是“五大主力”中最后一支被歼灭的王牌部队来看，说胡涟“能战”，不算是溢美之词。