白崇禧兼任第四战区司令长官，在武汉军事会议中，白崇禧建言提出“坚壁清野”、“焦土抗战”、“发展游击战、配合正规战”、“积小胜为大胜，以空间换取时间”等谋略。
一九四一年冬白崇禧编写了《游击战纲要》一书。一九四三年五月，chóng qìng成立中国宗教徒联谊会，白崇禧为常务理事之一。七月蒋介石派白崇禧到兰州，办理甘肃**善后事宜。九月出席国民党五届十一中全会。一九四四年一月一rì，以抗rì期间着有功绩，国民zhèng fǔ授白崇禧青天白rì勋章以资嘉奖。五月二十一rì，吴铁城、张群、熊式辉、张治中、王世杰、白崇禧、朱家骅会商党务，纠正陈果夫、陈立夫行动。五月rì寇沿粤线南犯，长衡会战爆发，蒋介石原要白崇禧前往四、九两战区指挥作战，白以蒋不听从他的在桂柳决战的主张，仅允传达统帅意旨，而不愿担任指挥任务。六月二十二rì白崇禧从chóng qìng飞桂林，先与第四战区司令长官张发奎会商，二十五rì白崇禧、张发奎召开第四战区高级将领会议，制定初期作战计划，成立桂林市城防司令部，派第十六集团军副总司令韦云淞为桂林防守司令：
七月十四rì，去湖南晤第九战区薛岳，建议该战区主力应部署在湘桂铁路两侧，使rì敌不敢沿湘桂路直驱直入而攻桂林，薛不允。九月，蒋介石派白崇禧以副参谋总长的名义前往第四战区指挥桂柳会战。十月三十rì，白崇禧从柳州飞返chóng qìng，向蒋介石报告湘桂战况，仍要求第九战区主力，应集中湘桂沿线作战，薛岳虽将杨森兵团、李玉堂兵团调入广西，但为时过迟，与第十六集团军未能紧密配合，终于出现湘桂大撤退，一泻千里的局面。十一月十rì柳州陷落，十一rì桂林失陷，桂柳会战以中**队的失败而告结束。十一月兼“海军整建委员会”委员。
一九四五年五月五rì国民党在chóng qìng召开六大，白崇禧在大会上做军事报告，十九rì当选为国民党第六届zhōng yāng委员，三十一rì被选为zhōng yāng执行委员会常务委员。吧月后着有《现代恼军军事教育之趋势》。十月三rì，国民zhèng fǔ令“陆军二级上将白崇禧晋任为陆军一级上将”。十月十rì授予抗战胜利勋童。十一月十一rì白崇禧参加复原整军会议，会前期期以为不可裁军，十三rì在整军会议宣布裁撤备军官分授及备班团。一九四六年一月四rì白崇禧自chóng qìng到南京，七rì何应钦自南京飞chóng qìng，白崇禧代理陆军总司令职，十rì自南京飞徐州视察，十二rì回京。三月一rì被选为国民党第六届zhōng yāng执行委员第二次全体会议主席团成员，十七rì选为zhōng yāng常务委员。五月七rì白崇禧、顾祝同等到青岛，十六rì白崇禧到北平，十七rì飞沈阳与杜聿明商讨东北作战问题，二十rì白崇禧、杜聿明自沈阳赴四平街视察，白主“乘胜”大举追击，二十二rì白崇禧离沈阳飞北平转南京，二十三rì随蒋介石再飞沈阳，三十rì随蒋到长chūn视察，并接见士绅，即飞习匕平，三十一rì自北平回抵南京。
一九四六年五月十五rì，国防最高委员会决议，任白崇禧为国防部长，二十三rì下特任令。五月三十一rì国民zhèng fǔ明令设立国防部，国防部长掌有关国防政策计划之筹划与建议、军事各项政策与方针策定颁布，及军政设施之审核督导、总动员有关事项之审议与建议，并指导国防部与zhèng fǔ备机关之联系及其实施之协调。六月一rì国防部在南京黄埔路zhōng yāng军校1rì址正式威立，白崇禧任第一任部长，只是“审定参谋总长所提关于国防需要之军事预算及人员物资之计划”，无任何决定权。七月二十三rì白崇禧到徐州视察，八月二十三rì飞牯岭，与蒋介石、马歇尔商谈战局，二十六rì自牯岭返南京。十月三rì国民zhèng fǔ派宋子文、白崇禧为绥靖区政务委员会正副主任委员，十一月成立国防科学委员会，白崇禧兼主任委员。’
一九四七年一月三十rì成立行政院绥靖区政务委员会督察团，白崇禧为团长，二月十三rì白崇禧抵南通，召开绥靖区会议，二十六rì到北平出席冀热区绥靖会议。三月三rì白崇禧到张家口，四rì到绥远，六rì到太原，七rì返回南京。二月二十八rì台湾爆发“二二八事变”，三月就rì白崇禧奉派准备赴台湾，十一rì国民zhèng fǔ派白崇禧前往台湾宣慰，对于此次纷扰事件权宜处l里，白崇禧对旅沪台人代表陈碧笙等申述处理台变方针（改革政制，取消专卖制度，台省省内省外人一律平等，派兵为国防上之需要，非为镇压人民）。三月十七rì白崇禧及蒋经国自南京到台北，即发表文告，宣布处理台湾事变四原则，十八rì访台湾参议会，并招待台北各界人士，二十二rì到台南，二十三rì到台中，二十五rì经新竹回抵台北，二十六rì在台北广播劝高山族检举现场逃逸．之“暴徒”。四月一rì白崇禧发表处理台湾善后五项办法，二rì自台湾返抵南京，七rì报告台湾事变善后，主改革政治经济制度，调整人事。四月二十三rì特任张群内阁政务委员兼国防部长。五月一rì，白崇禧在立法院报告军事，决”先完成统一”。六月十二rì王世杰、白崇禧出席立法院，说明北增山事件，七月十四rì白崇禧谈xīn jiāng情形复杂，东北军事危机未全解除。十一月七rì，蒋以虞电命令成立国防部九江指挥所，派白崇禧部长坐镇九江，进行统一指挥五省辖区作战，并指导豫皖赣湘鄂五省省zhèng fǔ和该省之保安部队，其任务是“彻底勘平津浦路以西，长江以北，平汉路以东，淮河以南大别山区匪乱，巩固治安”。十一月十rì蒋介石召见白崇禧，要他在九江设立国防部长指挥所，动员中原五省兵力，对刘邓大军采取防堵阻击措施，这是国共大战以来，蒋介．石第一次授予白崇禧以指挥权，他主张机动作战，但他的三百架运输机在全国五大战略区机动和集中十个整编旅骑兵的计划不为蒋所接受，十七rì“国防部长九江指挥所”宣告成立，主要力量是第五绥区和第八绥区部队和张淦第三兵团、张镇首都卫成司令部、直辖部队等，约二十余万人。十一月二十四rì白崇禧到蚌埠布置军事，二十七rì白崇禧到九江，主持华中战事，曾提出“总体战”口号，呼吁“全民动员，同灭共党”。十二月四rì白崇禧自九江抵汉口，指挥大别山区战事，对抗大别山的刘邓大军，五rì自汉口到信阳布置军事。十二月七rì白崇禧在汉口谈清剿计画，“加强地方自卫武力，军事与政治经济严密配合”，十二rì白崇福之指挥部自九江移汉口，十九rì自汉口到长沙视察。