八月十三日淞沪会战爆发，白崇禧曾以副参谋总长的身份视察前方被日军一夜击破，向蒋介石献策，认为纯粹被动防守非长久之计，徒增伤亡无法取胜，必须以一支主力突击部队主动出击，实行积极防御的策略，蒋介石求之不得下达了实施反击作战的命令十月十九日，〖中〗国守卫蔽藻浜南岸的部队，配合廖磊第二十一集团军发动全线反击当日，日军松井石根命令主力第九师团迎头相撞桂军初上战场，毫无与日军交锋经验，以血肉之躯勇敢的冲进密集弹雨，遭日军飞机、火炮、坦克和机枪密集火力突击，数万大军一日即被打散上万敢死队大部战死该集团军仅旅长即阵亡六七人“小诸葛”见桂系溃兵被其他部队收容，多年经营毁于一旦，不禁痛心疾首，连日饮食不进
一九三八年一月一日军事委员会改组白崇禧任军训部长，掌理陆海军训练整理、军事学校建设改进二月，白崇禧特邀周恩来、陈绍禹、秦邦宪对即将开赴徐州前线的广西学生军讲话三月二十四日，白崇禧随蒋介石至徐州视察，并留在徐州协助李宗仁指挥台儿庄会战，经常到战地与各军、师的高级将领联络，代表武汉大本营面致慰问，鼓舞士气四月六日至八日国民党召开五届四中全会，白崇禧增选为〖中〗央政治委员会委员五月十五日自徐州城内移往南门外段家花园，十六日撤离徐州五月，“〖中〗国回教救国协会”在武汉成立，
白崇禧任理事长七月十七日特任第五战区代理司令长官李宗仁因病住院动手术七月十九日，白崇禧得知日军第六师团沿长江北岸向西进犯武汉地区，立即部署第五战区李品仙兵团十二个师围歼这一路孤军，经大小战役数十次，反被日军击破并夺走田家镇要塞九月军训部由武汉迁祁阳，十二月迁桂林虞山庙十月十六日敌陷广东博罗，白崇禧自武汉赴广州指挥二十一日敌陷广州十一月三十日蒋介石令白崇禧兼任桂林行营主任，负责第三、四、七、九战区的作战，管理半壁江山白崇禧兼任第四战区司令长官，在武汉军事会议中，白崇禧建言提出“坚壁清野”、“焦土抗战”、“发展游击战、配合正规战”、“积小胜为大胜以空间换取时间”等谋略
一九四一年冬白崇禧编写了《游击战纲要》一一九四三年五月，重庆成立〖中〗国宗教徒联谊会，白崇禧为常务理事之一七月蒋介石派白崇禧到兰州，办理甘肃**善后事宜九月出席国民党五届十一中全会一九四四年一月一日，以抗日期间着有功绩，国民政府授白崇禧青天白日勋章以资嘉奖五月二十一日吴铁城、张群、
熊式辉、张治中、王世杰、白崇禧、朱家烨会商党务，纠正陈果夫、陈立夫行动五月日寇沿粤线南犯，长衡会战爆发蒋介石原要白崇禧前往四、九两战区指挥作战，白以蒋不听从他的在桂柳决战的主张仅允传达统帅意旨，而不愿担任指挥任务六月二十二日白崇禧从重庆飞桂林，先与第四战区司令长官张发奎会商，二十五日白崇禧、张发奎召开第四战区高级将领会议，制定初期作战计划，成立桂林市城防司令部，派第十六集团军副总司令韦云淞为桂林防守司令七月十四日，去湖南晤第九战区薛岳，建议该战区主力应部署在湘桂铁路两侧，使日敌不敢沿湘桂路直驱直入而攻桂林，薛不允九月，蒋介石派白崇禧以副参谋总长的名义前往第四战区指挥桂柳会战十月三十日，白崇禧从柳州飞返重庆，向蒋介石报告湘桂战况，仍要求第九战区主力，应集中湘桂沿线作战，薛岳虽将杨森兵团、李玉堂兵团调入广西，但为时过迟，与第十六集团军未能紧密配合，终于出现湘桂大撤退，一泻千里的局面十一月十日柳州陷落，十一日桂林失陷”桂柳会战以〖中〗**队的失败而告结束十一月兼“海军整建委员会”委员
一九四五年五月五日国民党在重庆召开六大，白崇禧在大会上做军事报告，十九日当选为国民党第六届〖中〗央委员，三十一日被选为〖中〗央执行委员会常务委员
有后着有《现代陆军军事教育点趋势》十月三日，国民政府令，一陆军二级上将白崇禧晋任为陆军一级上将”十月十日授予抗战胜利勋章十一月十一日白崇禧参加复原整军会议，会前期期以为不可裁军，十三日在整军会议宣布裁撤各军官分授及各班团一九四六年一月四日白崇禧自重庆到南京，七日何应钦自南京飞重庆，白崇禧代理陆军总司令职，十日自南京飞徐州视察，十二日回京三月一日被选为国民党第六届〖中〗央执行委员第二次全体会议〖主〗席团成员，十七日选为〖中〗央常务委员五月七日白崇禧、顾祝同等到青岛，十六日白崇禧到北平，十七日飞沈阳与杜聿明商讨东北作战问题二十日白崇禧、杜聿明自沈阳赴四平街视察，白主“乘胜”大举追击，二十二日白崇禧离沈阳飞北平转南京，二十三日随蒋介石再飞沈阳三十日随蒋到长春视察，并接见士绅，即飞北平，三十一日自北平回抵南京
一九四六年五月十五日，国防最高委员会决议，任白崇禧为国防部长，二十三日下特任令五月三十一日国民政府明令设立国防部，国防部长掌有关国防政策计划之筹划与建议、军事各项政策与方针策定颁布及军政设施之审核督导、总动员有关事项之审议与建议，并指导国防部与政府各机关之联系及其实施之协调六月一日国防部在南京黄埔路〖中〗央军校旧址正式成立，白崇禧任第一任部长只是“审定参谋总长所提关于国防需要之军事预算及人员物资之计划”无任何决定权七月二十三日白崇禧到徐州视察，八月二十三日飞牯岭，与蒋介石、马歇尔商谈战局，二十六日自牯岭返南京十月三日国民政府派宋子文、白崇禧为绥靖区政务委员会正副主任委员，十一月成立国防科学委员会，白崇禧兼主任委员
一九四七年一月三十日成立行政院绥靖区政务委员会督察团，白崇禧为团长二月十三日白崇禧抵南通，召开绥靖区会议，二十六日到北平出席冀热区绥靖会议三月三日白崇禧到张家口日到绥远，六日到太原七日返回南京二月二十八日台湾爆发“二二八事变”三月就日白崇禧奉派准备赴台湾，十一日国民政府派白崇禧前往台湾宣慰，对于此次纷扰事件权宜处理，白崇禧对旅沪台人代表陈碧笙等申述处理台变方针改草政制，取消专卖制度台省省内省外人一律平等，派兵为国防上之需要，非为〖镇〗压人民三月十七日白崇禧及蒋经国自南京到台北即发表文告，宣布处理台湾事变四原则十八日访台湾参议会，并招待台北各界人士，二十二日到台南，二十三日到台中，二十五日经竹回抵台北，二十六日在台北广播劝高山族检举现场逃逸之“1暴徒”四月一日白崇禧发表处理台湾善后五项办法，二日自台湾返抵南京，七日报告台湾事变善后，主改草政治经济制度，调整人事四月二十三日特任张群内阁政务委员兼国防部长五月一日，白崇禧在立法院报告军事，决”先完成统一”六月十二日王世杰、白崇禧出席立法院，说明北塔山事件，七月十四日白崇禧谈疆情形复杂，东北军事危机未全解除十一月七日，蒋以虞电命令成立国防部九江指挥所，派白崇禧部长坐镇九江，进行统一指挥五省辖区作战，并指导豫皖翰湘鄂五省省政府和该省之保安部队，其任务是“彻底勘平津浦路以西，长江以北，平汉路以东，淮河以南大别山区匪乱，巩固治安”十一月十日蒋介石召见白崇禧，要他在九江设立国防部长指挥所，动员中原五省兵力，对刘邓大军采取防堵阻击措施，这是国共大战以来，蒋介石第一次授予白崇禧以指挥权，他主张机动作战，但他的三百架运输机在全国五大战略区机动和集中十个整编旅骑兵的计划不为蒋所接受，十七日“国防部长九江指挥所”宣告成立，主要力量是第五绥区和第八绥区部队和张淦第三兵团、张镇首都卫戍司令部、直辖部队等，约二十余万人十一月二十四日白崇禧到蚌埠布置军事，二十七日白崇禧到九江，主持华中战事，曾提出“总体战”口号，呼吁“全民动员，同灭共党”十二月四日白崇禧自九江抵汉口，指挥大别山区战事，对抗大别山的刘邓大军，五日自汉口到信阳布置军事十二月七日白崇禧在汉口谈清剿计画，“加强地方自卫武力，军事与政治经济严密配合”十二日白崇禧之指挥部自九江移汉口，十九日自汉口到长沙视察@