杜让能还抗拒，唐昭宗说：“身为宰，不要推诿扯皮，要与朕同甘共苦。”杜让能泪说：“是现在的势不，不是我不奉行诏令，是担心又朝一日臣会像晃错一样遭受杀戮，我能以死报朝廷了！”
杜让能在中书省为了战争准备，一个多月没有家。
另一宰崔昭纬阴险狡诈，内结宦官，藩镇，暗地里与邠宁军、岐山军信息，杜让能早晨说的一句话，这两个州晚上就会。
凤翔镇岐山军的李茂贞得后，他的党羽纠集多人，观军容门君遂告状说：“李茂贞没有罪，不应当对他进行征讨，以免姓遭受战祸。”
门君遂说：“这是宰的，不是我的。”于是，人又拦住宰崔昭纬、郑延昌乘坐的轿子告状。
这两宰也说：“皇帝专门委太尉杜让能负责，我们也不。”姓一气之下，乱投砖瓦石块砸他们，崔昭纬、郑延昌慌忙下轿子躲藏，官印和上朝服装丢失了。
唐昭宗要捉拿发这闹的人，且杀死，再要出兵讨伐。长安的姓害怕，有的逃到山谷中藏匿来。
893年八月，唐昭宗覃王李嗣周为京招讨，神策大将军李鐬（hui）担副。
月十日，覃王李嗣周率领三万名禁军，护送的风翔节度徐彦若往凤翔镇赴，军队驻扎在兴县。
凤翔军李茂贞、邠宁军王行瑜联来，与官军抗拒，共出兵六万人，驻扎在周至县。
朝廷禁军是刚召募来的青少年，不会打仗，而李茂贞、王行瑜所带领的是戍边军士，经历过大大小小上的战斗，战斗力较。
月十七日，李茂贞等军队逼近兴，朝廷禁军竟不战而逃。李茂贞等乘胜东进，逼长安边的三桥，长安震惊。
士绅和姓处逃走，多姓聚集到皇宫门，请诛杀议发兵征伐的人。
崔昭纬故陷害宰杜让能，给李茂贞送信说：“朝延用兵不是皇帝的思，是太尉杜让能出的主。”
十日这，李茂贞军队陈列在长安城的临皋驿，唐昭宗进呈章，历数杜让能的罪行，请杀死他。
杜让能时无奈的对唐昭宗说：“我来就有预，现在就请过惩处我除战争。”
唐昭宗时不说大话了，哭着说：“朕对不住了，能与分！”当，就杜让能贬为梧州刺史。
唐昭宗又观军容门君遂到儋州，内枢密李周潼到崖州，段诩到欢州。
二，唐昭宗亲临安福门，又下令门君遂、李周潼、段诩处斩，杜让能再贬为雷州司户。
朝廷又派臣对李茂贞说：“蛊惑朕出兵的，是门君遂、李周潼和段诩三人，不是杜让能的罪过，朕已将他贬官了。”
朝廷宦官骆全瓘和刘景宣分担左、右神策军中尉。